月经干净三天后又来了，可能是以下原因引起：
1.排卵期出血
如果月经周期规律，在两次月经中间，即排卵期，由于雌激素水平短暂下降，使子宫内膜失去激素的支持而出现部分子宫内膜脱落引起有规律性的阴道出血，称为排卵期出血。出血量少，有的仅为咖啡色分泌物，一般2—3天可自行停止，最长7天。
2.功能性子宫出血
主要是下丘脑—垂体—卵巢轴功能失调，即月经病。
3.子宫肌瘤
尤其是子宫黏膜下肌瘤，因子宫腔面积扩大，于是收缩异常，可致月经过多和经期过长。
4.子宫内膜异位症
常因影响子宫肌层收缩或因内膜增强而导致月经过多或经期延长。
5.其他
如放置节育环，在白带中也混有一些血丝。
需要注意的是，一些全身性疾病如血液病、高血压、肝病、内分泌病、流产、宫外孕、葡萄胎、生殖道感染等均可引起月经失调。如果月经干净三天后又来了，持续时间较长或伴有其他不适症状，建议及时就医，进行相关检查，如B超、性激素六项等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。
此外，对于围绝经期女性，如果出现月经紊乱，更应重视，警惕子宫内膜病变的可能。
总之，月经干净三天后又来了是一种异常的子宫出血，需要引起重视，及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。同时，保持良好的生活习惯，注意休息和营养，有助于调节月经。
