成像原理不同、检查内容不同、辐射程度不同。
一、成像原理不同：
脑部核磁共振检查主要利用水分子在共振过程中成像。其原理是将人体置于强大的磁场中，通过特定频率的射频脉冲激发人体内的氢质子，使其产生共振信号，这些信号被接收和处理后形成图像，能清晰显示脑部组织结构和病变情况。而CT检查则是通过X射线对人体进行密集扫描成像。X射线穿过人体后，根据不同组织对射线的吸收程度差异来构建图像，可用于了解脑部不同部位的形态和结构。
二、检查内容不同：
脑部核磁共振检查可以通过成像清晰明确脑部病灶的详细情况，比如病变的位置、大小、形态、与周围组织的关系等，对于诊断脑部的各种疾病如肿瘤、炎症、缺血性病变等具有重要意义。脑部CT能准确检查出脑部具体是哪个部位发生了病变，像颅骨是否有损伤、血管的情况、脑组织的状态、脑室的大小等都能很好地显示出来。
三、辐射程度不同：
核磁共振检查不存在辐射问题，所以相对较为安全，适用于各类人群，包括部分特殊人群如婴幼儿和孕妇等。但CT检查具有一定的辐射性，因此对于部分敏感人群如婴幼儿或孕妇等，在某些情况下可能不适合进行CT检查，以避免可能对胎儿或婴幼儿健康造成的潜在影响。
总之，核磁共振检查和CT检查在脑部检查中各有特点和优势，医生会根据患者的具体情况和临床需要选择合适的检查方法。
