肺炎支原体和肺炎衣原体是两种不同的病原体，两者在生物学特性、传播途径、感染特点、治疗药物等方面存在区别。
1.生物学特性
肺炎支原体没有细胞壁，呈多形性，可通过滤菌器；而肺炎衣原体有细胞壁，形态较为规则，呈球形。
2.传播途径
肺炎支原体主要通过飞沫传播，在人群密集的环境中易传播；肺炎衣原体也可通过飞沫传播，但它还可能通过接触被污染的物品间接传播。
3.感染特点
肺炎支原体感染后，潜伏期较长，一般为2-3周，起病相对较缓，症状多样，除咳嗽、发热外，还可能伴有咽痛、头痛等；肺炎衣原体感染潜伏期通常为1-5周，症状相对较轻，以咳嗽、咳痰、发热等呼吸道症状为主，有时可能伴有声音嘶哑。
4.治疗药物
两者对大环内酯类抗生素如阿奇霉素、红霉素等均较为敏感，但肺炎支原体对多西环素、四环素、土霉素等四环素类药物也敏感，而肺炎衣原体对四环素类药物的敏感性相对较差。在治疗时，需根据具体病情和患者个体情况选择合适的药物。
