阿莫西林在合适的情况下可用于治疗中耳炎，尤其是由敏感菌引起的中耳炎，但并非对所有中耳炎都有效。
中耳炎是累及中耳（包括咽鼓管、鼓室、鼓窦及乳突气房）全部或部分结构的炎性病变，可分为化脓性和非化脓性两大类。
对于由肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、卡他莫拉菌等敏感细菌引起的化脓性中耳炎，阿莫西林是常用的治疗药物之一。阿莫西林属于β-内酰胺类抗生素，通过抑制细菌细胞壁合成发挥杀菌作用。在感染初期，足量足疗程使用阿莫西林，能有效控制细菌感染，减轻炎症反应，缓解耳痛、听力下降、耳鸣等症状，促进中耳内积液吸收。
然而，如果中耳炎是由病毒感染引起，或者致病菌对阿莫西林耐药，那么使用阿莫西林治疗则无效。此外，对于非化脓性中耳炎，如分泌性中耳炎，主要是由于咽鼓管功能障碍导致中耳内产生负压和积液，治疗重点在于改善咽鼓管通气引流功能，通常以鼻腔局部用药、咽鼓管吹张等治疗为主，抗生素并非主要治疗手段，使用阿莫西林也无法取得理想疗效。
