扁桃体隐窝是位于腭扁桃体内部的一些盲管样结构，是扁桃体的重要组成部分。
腭扁桃体是一对位于口咽部两侧舌腭弓和咽腭弓之间的淋巴组织，呈扁卵圆形。扁桃体隐窝是扁桃体表面上皮向扁桃体实质内陷入形成的6-20个深浅不一的盲管，这些隐窝的上皮内含有大量的淋巴细胞、浆细胞等免疫细胞，当外界病原体，如细菌、病毒等侵入人体时，可通过扁桃体表面的隐窝口进入隐窝内，刺激免疫细胞产生免疫反应，起到抵御病原体的作用。
由于扁桃体隐窝结构复杂、管腔狭窄，食物残渣、细菌、炎性分泌物等容易积存其中，难以排出，当机体抵抗力下降时，这些积存物就会滋生大量病原体，引发扁桃体炎症，导致扁桃体红肿、疼痛，出现发热、吞咽困难等症状。反复发生的扁桃体炎还可能导致隐窝内瘢痕形成，进一步影响隐窝的正常生理功能。
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