甲状腺结节疼痛不一定是良性的，也可能是恶性的。
多数甲状腺结节疼痛是良性病变引起，比如甲状腺结节伴囊性变，囊内出血时，肿块急剧增长，会引起牵张性疼痛；亚急性甲状腺炎、桥本甲状腺炎等炎症性疾病，也会导致甲状腺结节疼痛，亚急性甲状腺炎常伴有发热等全身症状，桥本甲状腺炎一般疼痛较轻。
但恶性结节也可能出现疼痛，当甲状腺癌侵犯周围组织或神经时，可能引发疼痛，但这种情况相对较少。
因此，不能仅凭疼痛症状判断甲状腺结节的良恶性，需结合其他症状、检查结果综合判断。若发现甲状腺结节伴有疼痛，应及时就医，进行甲状腺功能检查、超声检查、细针穿刺活检等，明确结节性质，以便采取合适的治疗措施。
