大便时肛门出血并伴有疼痛可能由肛裂、内痔、外痔、肛管或直肠肿瘤等多种肛肠疾病引起，也可能是其他疾病的症状，需要及时就医，进行详细检查以明确诊断，并采取相应的治疗措施。
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，常发生在肛门后位。典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。治疗方法包括保持大便通畅、局部坐浴、外用止痛软膏等。如果肛裂严重，可能需要手术治疗。
2.内痔：内痔是肛垫的支持结构、血管丛及动静脉吻合支发生病理性改变或移位。内痔一般无疼痛，以便血、痔核脱出为主要症状。严重时可出现喷射状出血。治疗方法包括改善生活习惯、外用药物（如痔疮膏、栓剂）、口服药物（如痔速宁片）等。保守治疗无效时可考虑手术治疗。
3.外痔：外痔位于齿线以下，是由痔外静脉丛曲张或肛缘皱襞皮肤发炎、肥大、结缔组织增生或血栓瘀滞而形成的肿块。外痔平时无特殊症状，发生血栓及炎症时可有肿胀、疼痛。治疗方法包括局部热敷、外用药物（如痔疮膏、栓剂）、口服药物（如迈之灵片）等。必要时可手术治疗。
4.肛管或直肠肿瘤：肛管、直肠肿瘤也可引起大便带血，伴有肛门疼痛。此外，还可能伴有大便习惯改变、消瘦、乏力等症状。对于中老年人，尤其是有肛肠疾病家族史者，应高度警惕肿瘤的可能。需要进行肛门指诊、结肠镜等检查，以明确诊断。
5.其他：肛管或直肠的其他疾病，如溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠结核等，也可导致大便时肛门出血并伴有疼痛。此外，一些全身性疾病，如白血病、血小板减少性紫癜等，也可引起肛肠症状。
总之，大便时肛门出血并伴有疼痛的原因较多，需要及时就医，进行详细的检查，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。在就诊前，应注意保持肛门局部清洁，避免食用辛辣刺激性食物，避免久坐、久站等。同时，对于儿童和老年人，以及有肛肠疾病家族史者，应更加重视，及时就医检查。
