夜里肛门痛可能由肛裂、肛周脓肿、肛管直肠恶性肿瘤、肛窦炎、外痔发炎、内痔嵌顿及其他肛管及直肠疾病引起，持续不缓解或伴有其他症状时应及时就医。
1.肛裂
肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，是一种常见的肛管疾病。典型表现为肛门疼痛、便秘和出血。患者应保持肛门清洁，多喝水，多吃膳食纤维，避免便秘。同时，可在医生指导下使用止痛药物和肛裂膏。
2.肛周脓肿
肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿，是常见的肛管直肠疾病。主要症状是肛周持续性剧痛，受压或咳嗽时加重，行走不便，坐卧不安。需要及时就医，医生会根据脓肿的位置和大小选择合适的治疗方法，如切开引流或使用抗生素。
3.肛管直肠恶性肿瘤
肛管直肠癌早期无明显症状，随着病情进展，可出现肛门疼痛、便血、大便习惯改变等。如果有家族史、长期吸烟、酗酒等高危因素，应及时就医，进行肛门指诊、结肠镜等检查，以排除恶性肿瘤的可能。
4.肛窦炎
是肛窦及肛门腺的炎症，常并发肛乳头炎。肛窦炎引起的肛门部下坠感有便意，每次排便时此种感觉尤其明显，但每次排出的粪便量并不多，常常伴有黏液，排出后这种感觉会减轻。肛窦炎经药物治疗无效，或肛窦内已成脓肿，或并有肛乳头肥大和隐性瘘管的患者，宜采用手术洽疗，只要的手术方法是肛窦切除术。
5.外痔发炎
自觉肛门肿胀、疼痛，有异物感，排便或活动后加重。如果形成血栓性外痔，则会疼痛剧烈，行走不便。治疗方法包括改变饮食习惯，保持大便通畅，热水坐浴，外用消炎止痛药物等。如果外痔已经形成血栓或脓肿，需要手术切除。
6.内痔嵌顿
多有内痔病史，每当腹压增加时，内痔脱出肛门外，不能及时回纳，痔核受肛门括约肌的夹持，静脉回流受阻，而动脉血仍不断输入，使痔核体积不断增大，直至动脉血管被压闭，血栓形成，出现痔核变硬、疼痛，难以送回肛门内。此时，患者应卧床休息，抬高患肢，立即到医院请医生把内痔送回肛门内。
7.其他
肛门部手术或损伤后，肛管及周围组织的炎症，可导致肛门疼痛，如肛瘘、肛裂手术后，肛管及肛周组织的损伤、感染等。此外，肛管及直肠的其他疾病，如直肠炎、肛乳头炎等，也可引起肛门疼痛。
总之，夜里肛门痛可能是一种严重的疾病的表现，也可能是一种轻微的不适。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如发热、便血、便秘等，应及时就医，以便明确诊断，采取相应的治疗措施。
