引起小肾结石的原因较为复杂，通常是多种因素共同作用的结果，主要包括饮食因素、代谢因素、泌尿系统因素、药物因素等。
1.饮食因素
某些食物中含有较高的草酸，如菠菜、甜菜、巧克力、浓茶等，过量摄入这些食物可能增加结石形成的风险。
牛奶、豆制品等食物中含有较多钙，虽然钙是人体必需的营养素，但过量摄入也可能与结石形成有关。
动物内脏、猪肉、牛肉、沙丁鱼等食物中含有较多嘌呤，摄入过多嘌呤会在体内代谢为尿酸，增加尿酸结石的形成几率。
2.代谢因素
尿液中钙、草酸、尿酸或胱氨酸等成分浓度过高，会导致这些物质在肾脏中结晶、聚集并逐渐形成结石。
某些代谢异常疾病与肾结石的形成有关，如胱氨酸尿症、高钙尿症、高草酸尿症、高尿酸尿症等，这些疾病会使尿液中的晶体成分过多，增加结石形成的风险。
3.泌尿系统因素
尿路感染是肾结石形成的一个重要因素，感染会导致尿液中的细菌和炎性细胞增多，这些物质会与晶体物质结合，形成结石。
泌尿系统的梗阻会使尿液滞留，尿液中的晶体成分更容易沉积，从而促进结石形成。
4.药物因素
长期服用维生素C、氨苯蝶啶、茚地那韦等，容易增加肾结石的风险，这些药物中的成分在代谢过程中可能会引起结石的形成。
