三个月宝宝吃母乳拉肚子，若为生理性腹泻，通常无需特殊处理；若为乳糖不耐受或其他原因，可采取调整饮食、腹部保暖、补充水分、添加辅食等措施，必要时就医治疗。
1.观察宝宝的情况：如果宝宝精神状态好，体重增长正常，可能是生理性腹泻，不需要特殊处理。如果宝宝精神状态差，体重增长缓慢，或者出现其他异常症状，应及时就医。
2.调整妈妈的饮食：如果宝宝拉肚子与妈妈的饮食有关，妈妈应避免食用辛辣、油腻、生冷等刺激性食物，以及容易引起过敏的食物。
3.注意宝宝的腹部保暖：可以用热水袋或热毛巾给宝宝热敷腹部，但要注意温度不要过高，以免烫伤宝宝。
4.给宝宝补充水分：如果宝宝拉肚子导致水分丢失过多，应及时给宝宝补充水分，可以口服补液盐或白开水。
5.可以考虑给宝宝添加辅食：一般来说，宝宝4-6个月开始添加辅食，但如果宝宝拉肚子持续时间较长，可以考虑提前添加辅食，以增加宝宝的营养摄入。
6.避免使用抗生素：如果宝宝拉肚子是由病毒感染引起的，使用抗生素不仅无效，还可能会导致肠道菌群失调。
7.就医治疗：如果宝宝拉肚子的情况严重，或者持续时间较长，应及时就医，医生会根据宝宝的具体情况进行诊断和治疗。
需要注意的是，三个月的宝宝还比较小，身体各器官尚未发育成熟，在治疗过程中应遵循医生的建议，避免自行用药。同时，妈妈在照顾宝宝时要注意个人卫生，勤洗手，避免交叉感染。
