亚急性甲状腺炎的指标主要有甲状腺功能指标、甲状腺自身抗体指标、炎症指标、甲状腺摄碘率指标等。
1.甲状腺功能指标
在甲状腺毒症期，血清游离三碘甲腺原氨酸（FT3）、游离甲状腺素（FT4）升高，促甲状腺素（TSH）降低，呈现甲亢样激素表现；甲状腺功能减退期，血清FT3、FT4逐渐下降至正常水平以下，TSH回升至高于正常值；恢复期，血清FT3、FT4、TSH可恢复至正常。
2.甲状腺自身抗体指标
抗甲状腺过氧化物酶抗体（TPOAb）和抗甲状腺球蛋白抗体（TGAb）常呈阳性，但滴度一般不高。
3.炎症指标
血沉在急性发作期明显增快，往往大于50mm/h，缓解期可逐渐恢复至正常水平；C-反应蛋白在急性期也常显著升高。
4.甲状腺摄碘率指标
初期常明显降低，一般<10%，甚至测不出，随着病情缓解，可逐渐恢复正常，与甲状腺激素水平变化呈分离现象。
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