扁平疣几年能自愈，要根据病情严重程度分析。病情轻微，一般2-3年能自愈；病情严重，则不能自愈。
1.一般2-3年能自愈
当扁平疣病情轻微时，患者仅在身体局部出现少量、较小的疣体，且疣体表面相对光滑，没有明显的瘙痒、疼痛等不适症状。此时，患者自身免疫系统对乳头瘤病毒有一定的抵抗能力。如果能保持良好的生活习惯，免疫系统可能会逐渐清除病毒，疣体在2-3年内可能自行消退。
2.不能自愈
若扁平疣病情严重，患者身上会出现大量、密集的疣体，疣体可能会融合成片，颜色加深，表面粗糙不平，还可能伴有明显的瘙痒、疼痛等不适。另外，如果患者长期处于精神压力大、焦虑、抑郁等不良情绪状态，会进一步削弱免疫功能，不能自愈，需要积极进行正规治疗。
建议扁平疣患者在医生意见下进行冷冻治疗，利用液氮低温使疣体组织坏死，操作相对简单，一般水疱会在1-2周内吸收、结痂、脱落。还可以采取光动力治疗，先在疣体部位涂抹光敏剂，待光敏剂被疣体细胞吸收后，再用特定波长的光照射，使疣体细胞发生光化学反应而死亡。
