肛瘘手术是根治肛瘘的主要方法，大部分患者通过规范手术可达到治愈效果，但复杂肛瘘存在一定复发风险，与手术方式、病情复杂程度等因素相关。
肛瘘是肛管或直肠与肛周皮肤之间的慢性感染性管道，手术的关键在于准确找到并彻底处理内口，清除感染的瘘管组织。对于低位单纯性肛瘘，手术方式相对简单，如瘘管切开术或切除术，通过切开或切除瘘管，使创面从基底部逐渐愈合，治愈率较高，可达90%以上，复发率较低。
而高位复杂性肛瘘，由于瘘管位置高、分支多，手术既要彻底清除病灶，又要尽可能保护肛门括约肌功能，避免术后大便失禁，手术难度较大，常用挂线疗法、肛瘘切开挂线术等，根治率约70%-85%，复发率在10%-30%。复发原因可能包括内口处理不彻底、瘘管分支遗漏、术后创面引流不畅、假性愈合等。
此外，肛瘘合并全身性疾病，如克罗恩病、糖尿病等，也会增加治疗难度和复发风险。为提高肛瘘手术根治率，患者应选择正规医院和经验丰富的医生进行手术，术后严格遵医嘱进行创面护理、定期换药，保持大便通畅，避免久坐、久站，以促进创面愈合，降低复发几率。
