直肠和肛门是不同的解剖结构，二者同属消化系统末端，在排便过程中相互协作却有着明确区别。
直肠是大肠的末段，上接乙状结肠，沿骶尾骨前方下行，穿过盆膈移行于肛管，成人直肠全长约12-15厘米。直肠管壁由黏膜层、黏膜下层、肌层和外膜构成，其黏膜形成半月形皱襞，可储存粪便。而肛门是消化道的最末端，包括肛管和肛门周围组织，肛管长约3-4厘米，上连直肠，下至肛门缘，其黏膜下有丰富的静脉丛，易形成静脉曲张引发痔疮。肛门由内、外括约肌控制，通过收缩和舒张调节排便。
直肠主要负责暂时储存粪便，当粪便积聚到一定量时，会刺激直肠壁内的感受器，产生便意。肛门则是粪便排出体外的通道，内括约肌是不随意肌，可协助控制排便，外括约肌为随意肌，能根据意识自主控制排便，同时肛门还能防止肠内容物不自主溢出和外界异物侵入。
此外，直肠和肛门在疾病表现和治疗上也存在差异。直肠常见疾病有直肠癌、直肠息肉等，多需通过直肠指检、肠镜检查诊断，治疗手段包括手术切除、放化疗等；肛门常见疾病，如痔疮、肛裂、肛瘘等，主要症状为疼痛、便血、肛门肿物脱出等，治疗以保守治疗或手术治疗为主。因此，直肠与肛门在人体消化系统中各有其位、各司其职，并非同一结构。
