肠胃镜一起做的时间通常在30分钟至1小时，但具体时长受患者个体情况、操作难度、是否进行镜下治疗等因素影响。
肠胃镜联合检查即先进行胃镜检查，再进行肠镜检查。胃镜检查时，医生将胃镜经口腔插入食管、胃、十二指肠，观察黏膜形态、色泽，判断是否存在病变，一般操作时间约10-20分钟。如果患者食管、胃、十二指肠结构正常，无明显病变，检查时间会相对较短；如果发现溃疡、息肉、肿瘤等病变，需取组织进行病理活检，或进行染色、放大观察，检查时间会延长至20-30分钟。
肠镜检查是将肠镜经肛门插入直肠、结肠，直至回盲部，观察肠道黏膜情况，正常操作时间约20-30分钟。但如果患者肠道准备不佳，肠腔内有粪便残留，会影响视野，增加操作难度，延长检查时间；如果患者肠道存在解剖变异（如冗长结肠），或有粘连、狭窄等情况，肠镜通过困难，也会使检查时间明显延长。此外，如果在检查过程中发现肠道息肉、出血等病变，需进行镜下切除、止血等治疗，整个检查时间可能延长至1-2小时甚至更久。
