宫颈纳囊通常是一种良性病变，癌变几率比较低。
宫颈纳囊多是由于宫颈转化区鳞状上皮取代柱状上皮过程中，新生的鳞状上皮覆盖宫颈腺管口或伸入腺管，将腺管口阻塞；或腺管周围的结缔组织增生或瘢痕形成压迫腺管，使腺管变窄甚至阻塞，腺体分泌物引流受阻、潴留形成囊肿。
从病理角度，宫颈纳囊的囊壁由宫颈腺上皮组成，内容物为清亮的黏液，这种结构和成分决定其性质稳定，一般不会发生癌变。然而，宫颈部位容易受到多种致病因素影响，如高危型人乳头瘤病毒（HPV）持续感染，可能导致宫颈上皮内瘤变甚至宫颈癌。在检查发现宫颈纳囊时，需同时进行宫颈细胞学检查（TCT）和HPV检测，以排除其他宫颈病变。如果合并有宫颈炎症，应积极治疗，防止炎症长期刺激影响宫颈健康。
