CT能为区分肺炎和肺结核提供重要依据，但常需结合临床症状与其他检查综合判断。
肺炎在CT影像上多呈现片状、斑片状密度增高影，边界模糊，炎症累及范围与致病菌相关。细菌性肺炎病灶常按肺叶、肺段分布，实变影内可见支气管充气征；支原体肺炎则表现为磨玻璃样影或网格状影，多位于肺外周。而肺结核CT表现复杂，原发性肺结核可见哑铃状原发综合征影像；继发性肺结核常见上叶尖后段、下叶背段的斑片状、结节状影，病灶内易出现空洞，空洞壁较厚且内壁不光整，部分还可见钙化灶，呈现“新旧病灶共存”的特点。
不过，CT影像存在一定重叠性。某些特殊类型肺炎，如干酪性肺炎，与肺结核的干酪样坏死病灶在CT上表现相似，均可见大片实变伴空洞；非典型病原体引发的肺炎，其磨玻璃影也可能与早期肺结核混淆。此外，病灶处于不同病理阶段时，影像表现也会发生变化，进一步增加了鉴别难度。
仅靠CT难以100%区分肺炎和肺结核。医生通常会结合患者发热、咳嗽咳痰、咯血等症状，以及痰涂片抗酸染色、结核菌素试验、γ-干扰素释放试验等实验室检查，必要时进行支气管镜活检或经皮肺穿刺活检，获取组织病理结果，才能准确诊断。
