有胎芽无胎心的发生涉及多种因素。胚胎因素中约50%60%早期自然流产由胚胎染色体异常所致，年龄大孕妇更易出现；母体因素包括内分泌（黄体功能不全、甲状腺功能异常）、感染（风疹病毒等感染）、免疫（自身免疫性疾病、母胎免疫调节失衡）及其他（全身性疾病、不良生活方式）；环境因素有接触放射性物质、化学毒物；父亲因素中精子染色体异常也可能导致胚胎发育异常。
一、胚胎因素
染色体异常是常见原因之一。大量研究表明，约50%60%的早期自然流产是由于胚胎染色体异常所致，包括数目异常（如三体、单体等）和结构异常。正常胚胎的染色体携带了确保其正常发育的遗传信息，当染色体出现异常时，会干扰胚胎的正常生长分化过程，导致有胎芽但无胎心的情况发生。这种情况在年龄较大的孕妇中相对更易出现，因为随着女性年龄增长，卵子质量下降，染色体发生异常的概率增加。
二、母体因素
1.内分泌因素
黄体功能不全：黄体分泌的孕酮对于维持妊娠至关重要。如果母体黄体功能不全，孕酮分泌不足，不能为胚胎的着床和发育提供良好的内分泌环境。例如，多项研究显示，黄体功能不全的孕妇发生胚胎发育异常、有胎芽无胎心的风险明显升高。甲状腺功能异常也会影响胚胎发育，甲状腺激素参与机体的新陈代谢和生长发育调控，甲状腺功能减退时，机体内分泌紊乱，会干扰胚胎的正常发育进程；甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也可能对胚胎造成不良影响，增加有胎芽无胎心的发生几率。
2.感染因素
孕妇在妊娠早期若受到某些病毒感染，如风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等。这些病毒可通过胎盘感染胚胎，影响胚胎的正常发育。例如，风疹病毒感染可导致胚胎的细胞分裂和分化受到阻碍，进而出现有胎芽无胎心的情况。研究发现，孕期感染风疹病毒的孕妇，胚胎发育异常的发生率显著高于未感染孕妇。
3.免疫因素
自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，母体的免疫系统会错误地攻击胚胎，引发免疫排斥反应，影响胚胎的血供和正常发育，从而导致有胎芽无胎心。母胎免疫调节失衡也是一个重要方面，正常妊娠需要母体的免疫系统对胚胎产生适度的免疫耐受，如果这种免疫耐受被打破，就可能导致胚胎受到免疫攻击而发育异常。
4.其他母体因素
全身性疾病，如严重的糖尿病未控制好，高血糖环境会影响胚胎的代谢和发育；高血压疾病，孕期高血压会导致胎盘血流灌注不足，使胚胎得不到充足的营养供应和氧气，影响其正常发育。此外，孕妇不良的生活方式，如吸烟、酗酒等，也会增加有胎芽无胎心的风险。吸烟产生的尼古丁等有害物质会影响胎盘的血管收缩，减少胎盘血供；酗酒则可能直接损害胚胎细胞的遗传物质和正常发育过程。
三、环境因素
孕妇接触过多的放射性物质，如在放射科工作未做好防护，或者长期处于有放射性污染的环境中，辐射会导致胚胎细胞的染色体断裂、基因突变等，影响胚胎的正常发育，出现有胎芽无胎心的情况。另外，接触某些化学毒物，如苯、甲醛等，这些化学物质可通过胎盘进入胚胎体内，干扰胚胎的正常生长发育过程，增加胚胎发育异常的风险。
四、父亲因素
父亲的精子染色体异常也可能导致胚胎发育异常。虽然相对母体因素来说，父亲因素导致有胎芽无胎心的比例较低，但也有相关研究表明，精子染色体异常会增加胚胎发生染色体疾病的概率，从而影响胚胎的正常发育，出现有胎芽无胎心的现象。
