乙脑自费和免费疫苗在疫苗种类、接种程序、覆盖范围及保护效果等方面存在区别，免费疫苗是国家免疫规划内按固定程序提供基础保护的疫苗，自费疫苗种类更丰富、接种程序相对自由、部分有独特设计但需自费，特殊人群接种时均需注意自身健康等情况。
一、疫苗种类方面
免费乙脑疫苗：通常是国家免疫规划内的疫苗，常见的有乙脑减毒活疫苗等。这类疫苗是按照国家统一的免疫程序为适龄儿童免费提供，其成分、质量等符合国家规定的标准，能为儿童提供基础的乙脑预防保护。例如，乙脑减毒活疫苗一般在儿童8月龄、2周岁各接种1剂次，对于符合国家免疫规划接种条件的儿童可免费接种，它通过刺激机体免疫系统产生抗体来预防乙脑病毒感染。
自费乙脑疫苗：包括乙脑灭活疫苗等多种类型。自费疫苗可以有更多的选择，比如有些家长可能会选择进口的乙脑灭活疫苗等。自费疫苗在品种上相对更丰富，能满足不同家长基于经济、对疫苗特性等多方面考虑的需求。像乙脑灭活疫苗可能接种剂次会有所不同，接种程序相对更灵活一些，但需要家长自行承担费用。
二、接种程序方面
免费乙脑疫苗：按照国家统一制定的免疫程序进行接种，是固定的接种时间和剂次安排。以我国大部分地区为例，国家免疫规划中的乙脑减毒活疫苗接种时间是明确规定的，严格遵循这个程序来保障儿童能及时获得基础免疫。
自费乙脑疫苗：接种程序相对自由一些。不同厂家生产的自费乙脑疫苗可能有不同的接种时间间隔和剂次要求。比如有的自费乙脑灭活疫苗可能在接种程序上与免费疫苗有所差异，家长可以根据自己的时间安排和对疫苗的选择来确定接种时间，但需要自行支付费用。
三、覆盖范围及保护效果方面
免费乙脑疫苗：能覆盖大部分人群的基础乙脑预防需求，经过大量的临床应用和研究验证，其在预防乙脑方面能达到国家规定的保护标准，对于符合免疫程序接种的人群能有效降低感染乙脑病毒的风险，在全国范围内为儿童构建起基本的乙脑免疫屏障。
自费乙脑疫苗：部分自费乙脑疫苗可能在某些方面有更独特的设计，比如在免疫原性等方面可能有不同的表现。但总体来说，其保护效果也是经过严格验证的，不过由于是自费选择，家长需要根据自身情况和对疫苗特性的了解来决定是否接种。例如一些进口的自费乙脑疫苗可能在运输保存等环节有更严格的要求，但相应的在质量把控等方面也有其特点，但都需要家长权衡费用和自身需求来选择。
对于特殊人群，比如儿童，在接种乙脑疫苗时都需要注意接种前要确保儿童身体健康，没有发热、急性疾病等禁忌证。如果是过敏体质的儿童，在接种乙脑疫苗前要详细告知医生，因为无论是免费还是自费疫苗，都存在个别儿童可能对疫苗成分过敏的风险。对于成年人，如果属于乙脑高发地区的高风险人群，也可以根据自身情况选择自费乙脑疫苗来进一步加强预防，但同样要关注自身健康状况和疫苗的禁忌情况等。
