流产不干净会引发多种严重后果，包括感染，残留妊娠组织易滋生细菌引发子宫内膜炎，进而发展成盆腔炎，影响受孕；出血、贫血，残留组织影响子宫收缩导致出血，使患者出现贫血症状、影响器官功能；宫腔粘连，残留组织停留过长致宫腔炎症纤维化，影响月经和生育；继发性不孕，感染导致的输卵管和宫腔问题及免疫异常增加不孕几率；极少数情况会发展为滋养细胞疾病，威胁健康，且曾患相关疾病的女性复发风险较高，这些问题对不同年龄段女性都会造成不同程度的身心影响。
一、感染
流产不干净时，子宫内残留的妊娠组织可以成为细菌滋生的良好培养基。细菌滋生后容易引发子宫内膜炎，患者可能会出现发热、下腹部疼痛、阴道分泌物增多且伴有异味等症状。若炎症得不到及时控制，可能会上行感染波及输卵管、卵巢等盆腔器官，导致盆腔炎。盆腔炎会引起长期的盆腔疼痛，严重时可能导致输卵管粘连、堵塞，影响日后受孕，增加宫外孕的发生风险。对于有多次流产史或本身抵抗力较弱的女性，如患有慢性疾病（糖尿病、艾滋病等）的女性，感染的风险更高且感染后病情可能更严重。
二、出血、贫血
妊娠组织残留会影响子宫的正常收缩和复旧，导致子宫无法有效关闭开放的血管，从而引起持续性或间断性的阴道出血。出血时间过长或出血量较大时，患者可能会出现贫血症状，如面色苍白、头晕、乏力、心慌、气短等。严重的贫血会影响身体各个器官的正常功能，使患者身体虚弱，抵抗力进一步下降，增加其他疾病的发生风险。对于本身就有贫血史或月经失血较多的女性，流产不干净导致的出血可能会使贫血症状更加严重。而老年女性由于身体机能下降，对贫血的耐受性更差，可能会出现更明显的不适症状。
三、宫腔粘连
流产后残留组织在子宫内停留时间过长，容易引起宫腔内的炎症反应和纤维化，进而导致宫腔粘连。宫腔粘连会使宫腔的形态和容积发生改变，影响子宫内膜的正常功能，导致月经量减少，甚至闭经。生育期女性会因此而难以受孕，即便怀孕，也容易发生流产、早产、胎盘植入等不良妊娠结局。有过多次宫腔操作史的女性，如多次人工流产、刮宫等，发生宫腔粘连的可能性更大。青春期女性如发生宫腔粘连，不仅会影响日后的生育功能，还会对其心理造成较大的影响。
四、激发性不孕
前面提到的感染造成的输卵管粘连堵塞和宫腔粘连等问题，是导致继发性不孕的重要原因。此外，长期的炎症因子刺激等还可能引起免疫功能异常，影响精子和卵子的结合、受精卵的着床等过程，增加不孕的几率。对于有生育计划的女性，流产不干净引发的这些问题对她们的生育愿望造成极大的阻碍，尤其是年龄较大的女性，随着年龄的增长，生育能力本身就在下降，一旦发生继发性不孕，治疗和恢复生育功能的难度更大。
五、滋养细胞疾病
极少数情况下，流产不干净残留的滋养细胞可能发生异常增生，进而发展为滋养细胞疾病，如葡萄胎、侵蚀性葡萄胎，甚至绒毛膜癌等。这些疾病具有一定的恶性潜能，会对患者的健康造成严重威胁，需要进行化疗等积极的治疗。有葡萄胎妊娠史等滋养细胞疾病病史的女性，再次发生滋养细胞疾病的风险相对较高。年轻女性若患滋养细胞疾病，可能需要多次化疗等较为复杂的治疗，这对其身体和心理都会造成巨大的冲击。
