小儿口腔疱疹多由病毒引起，部分可自愈，但严重时需干预，自愈情况因病毒类型和个体差异而异。
小儿口腔疱疹常见由单纯疱疹病毒、肠道病毒（如柯萨奇病毒A16、肠道病毒71型）感染所致。如感染单纯疱疹病毒引发的疱疹性龈口炎，若无继发感染，多数患儿在1-2周内，随着自身免疫系统识别并清除病毒，口腔内水疱、溃疡可逐渐结痂愈合。肠道病毒引起的手足口病或疱疹性咽峡炎，同样具有自限性，一般病程为7-10天，期间患儿体温逐渐恢复正常，口腔疱疹也会自行消退。
然而，若患儿免疫功能低下，或疱疹继发细菌感染，出现高热不退、精神萎靡、吞咽困难、口腔剧烈疼痛等症状，不仅会延长病程，还可能引发脑炎、心肌炎等严重并发症，此时自愈困难，需及时就医。临床上常采用对症治疗，如使用布洛芬退热、康复新液促进黏膜修复，针对肠道病毒71型感染，必要时还需使用干扰素α等抗病毒药物干预，以缓解症状、降低并发症风险，帮助患儿尽快恢复健康。
