眼睛结石通常由眼部慢性炎症刺激、睑板腺功能异常、环境因素影响引起，眼部慢性炎症刺激致眼结膜上皮细胞代谢异常形成结石，睑板腺功能异常影响眼表微环境促使结石形成，粉尘多、空气污染重等环境因素刺激眼结膜易引发结石。
眼部慢性炎症刺激：长期患有沙眼、慢性结膜炎等眼部慢性炎症疾病时，炎症会导致眼结膜上皮细胞代谢异常，使脱落的上皮细胞和变性的白细胞凝固堆积形成结石。例如，沙眼患者由于沙眼衣原体感染，会持续刺激结膜，容易引发眼睛结石。在儿童中，如果长期处于卫生条件较差的环境，经常用手揉眼等，也可能诱发眼部慢性炎症，进而增加眼睛结石的发生风险；对于患有糖尿病等基础疾病的人群，机体抵抗力相对较低，眼部更容易受到炎症侵袭，也较易出现眼睛结石。
睑板腺功能异常：睑板腺分泌油脂对眼表起到润滑等重要作用，当睑板腺功能出现异常时，油脂分泌失衡，会影响眼表的微环境，使得眼结膜的代谢和修复受到影响，从而促使眼睛结石形成。年轻人如果长期熬夜、过度使用电子设备等，可能会影响睑板腺的正常功能；中老年人群随着年龄增长，睑板腺功能也会逐渐衰退，相对更容易出现睑板腺功能异常相关的眼睛结石问题。
环境因素影响：长期处于粉尘较多、空气污染严重的环境中，粉尘等异物容易进入眼内，刺激眼结膜，导致结膜的损伤和异常修复，进而引发眼睛结石。例如在矿山工作的人群，长期暴露在粉尘环境中，眼睛结石的发生率相对较高；生活在风沙较大地区的居民，也由于经常接触沙尘等异物刺激，增加了眼睛结石的发生几率。
