艾滋病起源与人类免疫缺陷病毒（HIV）跨物种传播密切相关，HIV-1亲缘最近野生宿主是非洲黑猩猩和大猩猩，人类因捕猎食用受感染黑猩猩等接触其前体病毒并适应变异传播扩散，HIV-2亲缘最近野生宿主是非洲曼德拉小羚羊，人类因接触感染HIV-2，且HIV-2传播范围相对较窄，艾滋病是人类感染灵长类动物跨物种传播而来的HIV病毒所致。
HIV-1的起源
跨物种传播：HIV-1的亲缘关系最近的野生宿主是非洲的黑猩猩和大猩猩。研究表明，人类可能是通过捕猎、食用受感染的黑猩猩或大猩猩而接触到了HIV-1的前体病毒。这种病毒在人类中逐渐适应并发生变异，最终形成了可以在人类群体中传播的HIV-1毒株。例如，通过对黑猩猩体内的类似HIV病毒（SIVcpz）与人类HIV-1的基因序列进行比对，发现它们具有高度的相似性，这为HIV-1从黑猩猩跨物种传播到人类提供了有力的基因证据。
传播扩散：随着人类社会的发展，人员的流动等因素使得HIV-1在人类群体中逐渐传播开来。在20世纪初，可能由于一些偶然的事件，比如在非洲的某些地区，这种跨物种传播后的病毒开始在人群中以逐渐增加的速度传播，进而蔓延到全球各地。
HIV-2的起源
跨物种传播：HIV-2的亲缘关系最近的野生宿主是非洲的曼德拉小羚羊。人类可能是通过与感染了SIVsm（曼德拉小羚羊体内的类似HIV病毒）的曼德拉小羚羊接触而感染了HIV-2。与HIV-1相比，HIV-2在全球的传播范围相对较窄，主要在西非地区有较多的感染病例。对HIV-2和SIVsm的基因序列分析也证实了它们之间的密切关联，显示出HIV-2是从曼德拉小羚羊跨物种传播到人类的。
总的来说，艾滋病是由于人类感染了从灵长类动物跨物种传播而来的HIV病毒所导致的，这一过程涉及到特定灵长类动物体内病毒与人类的接触以及后续在人类群体中的传播演变。
