艾滋病病程分为急性期、无症状期和艾滋病期。急性期多在感染后2-4周，有发热、咽痛、消化道症状、皮疹等，1-3周可缓解；无症状期可持续数年，体内病毒破坏免疫系统，不同人群进展有差异；艾滋病期免疫系统严重破坏，出现机会性感染（如肺孢子菌肺炎、消化道感染、皮肤黏膜感染）和肿瘤（如卡波西肉瘤），不同人群表现有别。
无症状期症状
在急性期之后进入无症状期，此期可持续数年，一般6-8年左右，但也有个体差异。在无症状期，感染者通常没有明显的临床症状，看起来和健康人一样。不过，体内的艾滋病病毒在持续破坏免疫系统，主要是攻击CD4+T淋巴细胞。不同年龄人群在无症状期的进展可能不同，儿童由于免疫系统发育尚未成熟，相对成年人可能更容易进展到艾滋病期；而有基础疾病的人群，如本身有糖尿病等慢性疾病的感染者，可能因为基础疾病的影响，免疫系统功能进一步受到干扰，无症状期可能相对较短。
艾滋病期症状
当免疫系统被严重破坏，CD4+T淋巴细胞计数明显下降时，就进入艾滋病期。此期会出现各种机会性感染和肿瘤等相关症状。机会性感染方面，可能出现肺孢子菌肺炎，表现为发热、咳嗽、呼吸困难等，咳嗽可为干咳或伴有少量痰液，呼吸困难在活动后会加重；还可能有消化道的机会性感染，如白色念珠菌感染引起的食管炎、肠炎，食管炎表现为吞咽疼痛、胸骨后疼痛，肠炎则表现为长期腹泻，每日腹泻次数可达数次至十余次，粪便多为稀水样便；皮肤黏膜也可能出现各种感染，如带状疱疹，表现为沿神经分布的群集性水疱，伴有明显疼痛；还可能出现口腔毛状白斑等口腔病变。肿瘤方面，常见的有卡波西肉瘤，表现为皮肤出现紫红色或蓝紫色的斑疹、丘疹、结节等，可发生在身体多个部位。对于不同年龄的人群，儿童艾滋病期可能更容易出现生长发育迟缓等情况，女性感染者在艾滋病期可能还会受到月经周期紊乱等影响，而有不良生活方式的感染者，如长期大量饮酒的人，在艾滋病期可能身体状况恶化更快。
