小儿病毒性肠炎由病毒感染引起，有消化道症状如腹泻（黄色水样便，每日数次至十余次）、呕吐（先于腹泻出现，呕吐物多为胃内容物）；全身症状有发热（低热至中度发热，少数高热）、脱水（分轻、中、重度，表现不同）；还有腹痛（哭闹不安，腹泻前可能有肠痉挛腹痛），不同年龄小儿表现略有差异，接触污染物品等易发病，基础疾病小儿症状可能更重。
消化道症状：
腹泻：多为黄色水样便，无黏液及脓血，每日数次至十余次不等。这是因为病毒侵袭肠道，导致肠道黏膜受损，吸收功能障碍，水分和电解质不能正常吸收而引起腹泻。例如轮状病毒引起的肠炎，常表现为频繁的水样腹泻。
呕吐：可先于腹泻出现，呕吐物多为胃内容物。病毒感染刺激胃肠道，引起胃肠蠕动紊乱，导致呕吐。
全身症状：
发热：部分患儿可出现发热，体温一般为低热至中度发热，少数可出现高热。这是机体对病毒感染的免疫反应所致，病毒作为外来抗原，刺激机体免疫系统，引发发热等一系列反应。
脱水症状：由于频繁腹泻和呕吐，机体丢失大量水分和电解质，可出现不同程度的脱水。轻度脱水表现为尿量减少、口渴、前囟及眼窝稍凹陷；中度脱水除上述症状外，还可出现精神萎靡或烦躁不安、皮肤干燥、弹性差、哭时泪少等；重度脱水则表现为无尿、精神极度萎靡、嗜睡甚至昏迷，皮肤弹性极差、眼窝及前囟深陷、四肢厥冷等。因为腹泻导致水分丢失，而水分和电解质的平衡对于维持机体正常生理功能至关重要，大量丢失后会影响各个器官的功能。
其他症状：
腹痛：患儿可能会出现腹痛，表现为哭闹不安，尤其是在腹泻前可能会有肠痉挛引起的腹痛。这是因为肠道蠕动加快、痉挛等原因导致。对于婴幼儿来说，腹痛可能会通过哭闹等方式表现出来，需要家长密切观察。
对于小儿病毒性肠炎，不同年龄的小儿表现可能略有差异。例如新生儿时期，由于其生理功能尚未完全发育成熟，症状可能不典型，除了腹泻、呕吐外，可能更容易出现精神萎靡、拒奶等情况。在生活方式方面，若小儿接触了被病毒污染的物品或水源等，容易感染发病。对于有基础疾病的小儿，如免疫功能低下的患儿，感染病毒性肠炎后症状可能更重，病程可能更长，需要更加密切的监测和护理。
