甲亢灵片副作用相对较少，少数患者可能有轻度消化系统不适；儿童使用需谨慎，老年患者因肝肾功能减退易增副作用风险，妊娠期和哺乳期女性一般不建议使用，若用需医生严密指导。
目前临床研究及用药监测显示，甲亢灵片可能出现的副作用相对较少，但少数患者可能会出现消化系统方面的不适，例如个别患者可能会有轻度的胃部不适，表现为服药后稍有恶心、胃脘部胀满等感觉。这主要是因为药物成分可能对胃肠道黏膜有一定的刺激作用，但这种情况发生的概率较低。从药物作用机制来看，甲亢灵片主要成分含有墨旱莲、丹参、夏枯草等，这些成分进入人体后，可能会在一定程度上影响胃肠道的正常功能状态。
特殊人群需关注的副作用相关情况
儿童患者：由于儿童处于生长发育阶段，机体各器官功能尚未完全成熟，目前关于儿童使用甲亢灵片的副作用研究相对有限，但一般不建议低龄儿童随意使用该药物。因为儿童对药物的耐受性和代谢能力与成人不同，使用不当可能会增加出现副作用的风险，而且其胃肠道等器官对药物刺激的反应可能更为敏感，所以儿童使用时需格外谨慎，必须在医生严格评估后，权衡利弊再考虑是否使用。
老年患者：老年患者往往伴有不同程度的基础疾病，肝肾功能可能有所减退。甲亢灵片需要经过肝肾进行代谢，老年患者使用时可能会因为肝肾功能的减退而影响药物的代谢过程，从而增加出现副作用的可能性，比如更易出现上述所说的胃部不适等消化系统方面的反应。所以老年患者使用该药物时，医生需要密切监测其肝肾功能以及用药后的身体反应。
妊娠期和哺乳期女性：妊娠期女性体内的生理状态发生了很大变化，药物可能会通过胎盘影响胎儿的发育；哺乳期女性药物可能会通过乳汁传递给婴儿。目前关于甲亢灵片在妊娠期和哺乳期女性中的副作用情况缺乏足够充分的研究数据，为了避免可能对胎儿或婴儿造成未知的不良影响，妊娠期和哺乳期女性一般不建议使用甲亢灵片，若有用药需求必须在医生的严密指导下进行，医生会综合评估用药的必要性和潜在风险。
