非淋菌性尿道炎由沙眼衣原体、解脲脲原体等非淋菌病原体引起，男性患者有尿道刺痒灼痛、尿道分泌物、尿频尿急等症状；女性患者有尿道不适、阴道分泌物增多、宫颈炎表现等；还可能出现新生儿感染及无症状感染情况。
男性患者症状：
尿道刺痒、灼痛：程度轻重不一，部分患者感觉尿道内有轻微的刺痒感，时有时无，在排尿时或排尿后可能会出现灼痛，尤其是在尿液浓缩时，灼痛可能会更明显。这种不适症状可能会持续存在，影响患者的日常生活和工作，对于有不良生活方式（如长期熬夜、过度劳累等）的男性，可能会使症状相对更明显。
尿道分泌物：多数患者会有尿道分泌物，分泌物一般较稀薄，呈浆液性，量相对较少，有时需要晨起时挤压尿道才能发现少量分泌物附着于尿道口，分泌物颜色多为清亮或微黄。如果患者合并有其他感染或自身免疫状态有变化（如有基础疾病导致免疫力下降等），分泌物的性状可能会有所改变。
尿频、尿急：患者会出现排尿次数增多，即尿频，同时有尿意急迫，很难忍耐，需要尽快排尿。这是因为炎症刺激尿道黏膜，导致尿道黏膜敏感性增高，从而引起膀胱的频繁收缩，出现尿频、尿急症状。在儿童患者中，由于表述能力相对较弱，可能会表现为频繁地去厕所，但每次尿量不多，需要家长密切观察。
女性患者症状：
尿道不适：女性患者也会有尿道刺痒、灼热感等不适，但相对男性可能症状不那么典型。部分女性可能仅感觉尿道有轻微的异样感，容易被忽视。女性的尿道较短且直，解剖结构特点使得炎症更容易扩散，但症状表现可能因个体差异而有所不同，比如有性生活频繁等生活方式的女性，可能更易受到感染且症状相对更明显。
阴道分泌物增多：阴道会出现分泌物增多的情况，分泌物性状可为白色、透明或微黄色等，质地可稀可稠。这是因为非淋菌病原体感染后，阴道内的微生态环境被破坏，导致分泌物异常增多。对于有妇科基础疾病（如阴道炎等）的女性，感染非淋菌性尿道炎后，阴道分泌物增多的症状可能会加重，且与原有妇科疾病的症状相互干扰，增加诊断难度。
宫颈炎表现：部分女性患者可合并宫颈炎，表现为宫颈充血、水肿、触痛等，宫颈分泌物也会增多，外观可能呈黏液脓性。在妊娠期女性中，合并非淋菌性尿道炎及宫颈炎可能会对妊娠造成影响，如增加早产、胎膜早破等风险，需要特别关注。
其他情况：
新生儿感染：如果母亲患有非淋菌性尿道炎，在分娩时新生儿通过产道可能会被感染，引起新生儿结膜炎或新生儿肺炎等。新生儿结膜炎表现为眼结膜充血、水肿、有分泌物等；新生儿肺炎则可能出现呼吸增快、咳嗽、气促等症状，严重影响新生儿的健康，需要及时诊断和治疗。
无症状感染：部分患者可能没有明显的自觉症状，仅在体检或因其他疾病就医时通过相关检查发现感染，这种情况在一些免疫力较强或感染初期症状不明显的人群中较为常见，比如长期服用免疫抑制剂的患者，由于自身免疫力被抑制，可能感染后症状不典型，容易漏诊。
