自身免疫性肝炎确切病因未完全明确，主要与遗传因素、免疫调节异常、环境因素相关。遗传因素中遗传易感性及HLA基因等起作用，不同人群因遗传背景等发病风险有差异；免疫调节异常致T、B淋巴细胞功能异常引发炎症；环境因素里病毒感染可改变肝细胞抗原性，某些药物可通过半抗原作用诱发，不同年龄人群对病毒感染易感性不同，个体对药物反应因遗传背景等有差异
遗传因素
遗传易感性在自身免疫性肝炎的发病中起到重要作用。研究发现，某些基因位点的多态性与自身免疫性肝炎的发病风险增加相关。例如，人类白细胞抗原（HLA）基因复合体中的某些等位基因与自身免疫性肝炎的易感性密切相关。HLA基因编码的抗原分子在免疫识别过程中发挥关键作用，特定的HLA基因型可能使个体更容易出现自身免疫调节异常，从而引发针对肝脏组织的自身免疫反应。不同年龄、性别的人群，由于遗传背景的差异，其自身免疫性肝炎的发病风险可能有所不同。一般来说，女性患自身免疫性肝炎的概率相对高于男性，这可能与女性的某些遗传因素以及激素水平等综合作用有关。对于有自身免疫性肝炎家族史的人群，其发病风险会高于普通人群，需要更加密切地关注肝脏健康状况。
免疫调节异常
正常情况下，机体的免疫系统能够识别自身组织和外来抗原，并维持免疫耐受。但在自身免疫性肝炎患者中，免疫调节机制出现紊乱。例如，T淋巴细胞的功能异常，自身反应性T细胞不能被有效清除或受到抑制，导致其过度活化，进而攻击肝脏细胞。B淋巴细胞也会受到影响，产生过多针对肝脏自身抗原的自身抗体，如抗核抗体（ANA）、抗平滑肌抗体（SMA）等。这些自身抗体与肝脏细胞表面或内部的抗原结合，形成免疫复合物，进一步引发炎症反应，导致肝细胞损伤。不同生活方式的人群，免疫调节异常的发生风险可能存在差异。长期处于精神压力过大状态的人群，由于应激反应可能影响免疫系统的平衡，增加自身免疫性肝炎的发病几率；而长期酗酒的人群，酒精会损伤肝细胞，破坏肝脏的免疫微环境，也可能促使免疫调节异常的发生，从而诱发自身免疫性肝炎。对于有自身免疫性肝炎发病风险的人群，保持良好的心理状态和健康的生活方式，如适度运动、合理饮食等，有助于维持免疫平衡，降低发病风险。
环境因素
某些环境因素可能触发自身免疫性肝炎的发病。例如，病毒感染可能是一个重要的环境诱因。一些病毒感染后，可能会改变肝细胞的抗原性，使得免疫系统将肝细胞误认为外来异物进行攻击。例如，甲型肝炎病毒、乙型肝炎病毒等感染后，有可能引发自身免疫反应的激活，进而导致自身免疫性肝炎的发生。不同年龄阶段的人群对病毒感染的易感性不同，儿童由于免疫系统尚未完全发育成熟，相对更容易受到病毒感染的影响，从而增加自身免疫性肝炎的发病风险；而老年人由于机体免疫力逐渐下降，也可能在病毒感染后更容易出现免疫调节异常，引发自身免疫性肝炎。此外，某些药物也可能作为环境因素诱发自身免疫性肝炎。一些药物可能通过半抗原作用，与肝细胞蛋白结合形成新的抗原，刺激机体产生免疫反应，导致肝脏炎症损伤。但不同个体对药物的反应存在差异，这与个体的遗传背景、代谢能力等因素有关。例如，某些具有乙酰化代谢途径的个体，可能对特定药物的代谢速度不同，从而影响药物在体内的作用及是否引发自身免疫性肝炎的风险不同。
