肾结石的形成受代谢、局部、其他等因素影响。代谢因素包括尿液中某些成分过饱和（如高钙尿症、高草酸尿、高尿酸尿、胱氨酸尿等致相应结石形成）及尿液pH值异常影响结石形成；局部因素有尿路感染（细菌等可作核心促使结石形成）和尿路梗阻（致尿液潴留易形成结石）；其他因素涉及年龄（不同年龄成因不同）、性别（一般男性概率高，女性特殊情况也可增加风险）、生活方式（饮水少、饮食不均衡易致结石）、病史（甲状旁腺功能亢进、肠道疾病病史易引发肾结石）。
一、代谢因素
1.尿液中某些成分过饱和
尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等成分的浓度过高，超过了尿液的溶解度，就容易形成结晶，进而发展为肾结石。例如，高钙尿症是导致肾结石的常见代谢异常情况，当尿液中钙的排泄量增加时，尿钙浓度升高，就容易形成草酸钙结石的核心物质。从科学研究来看，有研究表明约60%的肾结石患者存在高钙尿症的情况。
高草酸尿也是重要因素，饮食中摄入过多富含草酸的食物，如菠菜、甜菜、巧克力等，或者肠道疾病导致草酸吸收过多等，都会使尿液中草酸含量升高。有研究发现，高草酸尿患者发生肾结石的风险比正常人群高很多。
高尿酸尿主要见于痛风患者或者尿酸排泄异常的人群，尿酸在尿液中浓度过高时，容易形成尿酸结石。
胱氨酸尿是一种遗传性疾病，由于肾小管对胱氨酸等氨基酸重吸收障碍，导致尿液中胱氨酸浓度升高，从而形成胱氨酸结石。
2.尿液pH值异常
尿液pH值影响结石的形成。例如，尿酸结石在酸性尿液中容易形成，而磷酸镁铵结石则在碱性尿液中易形成。当人体的酸碱平衡失调时，尿液的pH值发生改变，就会促进相应成分结石的形成。比如，泌尿系统感染时，细菌分解尿素产生氨，使尿液呈碱性，容易形成磷酸镁铵结石。
二、局部因素
1.尿路感染
尿路感染时，细菌、脓块等可以作为结石形成的核心，促使尿液中的矿物质围绕其沉积形成结石。例如，变形杆菌等细菌能分解尿素产生氨，使尿液碱化，有利于磷酸镁铵、磷酸钙等结石的形成。有临床研究显示，反复发作尿路感染的患者发生肾结石的概率明显高于无尿路感染的人群。
2.尿路梗阻
尿路梗阻会导致尿液引流不畅，尿液在肾脏内潴留，使尿液中的溶质浓度升高，容易形成结晶并沉积，进而形成结石。比如，肾盂输尿管连接处狭窄、输尿管结石等都可引起尿路梗阻。长期的尿路梗阻还会导致肾脏积水，进一步损害肾功能，同时加重结石的形成。有研究表明，尿路梗阻患者中肾结石的发生率比正常人群高约3-5倍。
三、其他因素
1.年龄
不同年龄阶段肾结石的形成原因有所不同。儿童时期，先天性尿路畸形等因素可能是导致肾结石的重要原因，比如先天性肾盂输尿管连接部梗阻等，可引起尿液引流不畅从而形成结石。而在成年人中，代谢因素相对更为突出，如高钙尿、高草酸尿等代谢异常情况较为常见。老年人由于肾功能减退、肾小管重吸收功能下降等原因，也容易出现尿液中某些成分异常，增加肾结石的形成风险。
2.性别
一般来说，男性患肾结石的概率高于女性。这可能与男性的一些生理特点和生活方式有关。男性通常运动量相对较大，出汗较多，尿液浓缩，使尿液中溶质浓度升高，增加了结石形成的风险；此外，男性的一些代谢相关指标也可能与女性存在差异，比如尿酸水平等。但这也不是绝对的，女性在某些特殊情况下，如绝经后激素水平变化等，也可能增加肾结石的形成风险。
3.生活方式
饮水过少是一个重要的生活方式因素。如果每天饮水量不足，尿液会过度浓缩，导致尿液中各种溶质的浓度升高，容易形成结晶。有研究指出，每天饮水量少于1500毫升的人群，肾结石的发生率明显高于每天饮水量大于2000毫升的人群。
饮食不均衡也会影响肾结石的形成。如高动物蛋白、高糖饮食等会使尿液中钙和尿酸的排泄增加，增加结石形成风险；而低纤维饮食可能影响肠道对草酸的吸收等。
4.病史
有甲状旁腺功能亢进病史的患者，由于甲状旁腺激素分泌过多，会导致血钙升高，进而使尿钙升高，容易形成肾结石。有肠道疾病病史，如炎症性肠病等，会影响肠道对草酸的吸收和代谢，增加尿液中草酸的含量，从而增加肾结石的形成风险。
