扁桃体炎的发生与多种因素相关，病原体感染方面，细菌如A组乙型溶血性链球菌、葡萄球菌、肺炎链球菌，病毒如腺病毒、鼻病毒、流感病毒均可引发；自身免疫力因素上，儿童免疫系统未成熟易受侵，成人免疫力低下如不良生活方式、患慢性疾病等易发病；局部因素包括扁桃体隐窝引流不畅及邻近器官炎症蔓延；其他因素有不良生活方式如吸烟、饮酒影响，还有季节交替等气候因素致抵抗力下降易引发且易反复。
一、病原体感染
1.细菌感染：
A组乙型溶血性链球菌：是引发扁桃体炎最常见的致病菌。这种细菌常存在于人体的咽部及扁桃体隐窝内，当人体抵抗力下降时，如受凉、过度劳累等情况，细菌大量繁殖，从而引发扁桃体炎。例如，有研究显示，在儿童群体中，A组乙型溶血性链球菌感染导致的扁桃体炎较为多见，儿童由于自身免疫系统发育尚不完善，相对更容易受到该细菌的侵袭。
葡萄球菌、肺炎链球菌：也可引起扁桃体炎，这些细菌可以通过空气飞沫传播等途径进入人体扁桃体部位，当人体局部或全身抵抗力降低时，就会在扁桃体部位繁殖致病。
2.病毒感染：
腺病毒：是引起扁桃体炎的常见病毒之一。腺病毒感染具有一定的季节性，在冬春季节较为多见。腺病毒可通过接触被污染的物品或飞沫传播，感染人体后会在扁桃体等部位复制，引发炎症反应。例如，在学校等人群密集场所，腺病毒容易造成局部的传播流行，导致多人出现扁桃体炎相关症状。
鼻病毒、流感病毒：也可引起扁桃体炎。流感病毒感染时，除了引起全身流感样症状外，也常常累及扁桃体，导致扁桃体出现红肿、疼痛等炎症表现。鼻病毒感染则多引起普通感冒相关症状，同时可能伴有扁桃体的炎症反应。
二、自身免疫力因素
1.儿童自身特点：
儿童时期免疫系统尚未完全发育成熟，扁桃体作为人体免疫系统的一部分，在抵御病原体方面发挥着重要作用，但由于免疫系统功能相对较弱，更容易受到病原体的侵袭而发生炎症。例如，幼儿阶段的儿童，扁桃体相对较大，接触外界病原体的机会较多，当遇到病原体入侵时，自身的免疫防御能力可能不足以迅速有效地将病原体清除，从而容易反复发生扁桃体炎。
2.成人免疫力低下情况：
成年人如果长期处于不良的生活方式下，如长期熬夜、过度劳累、缺乏运动等，会导致自身免疫力下降。当免疫力下降时，原本处于人体扁桃体隐窝内的少量病原体就可能大量繁殖，引发扁桃体炎。此外，患有一些慢性疾病，如糖尿病、艾滋病等，也会影响人体的免疫系统功能，使人体更容易发生扁桃体炎且不易痊愈，容易出现反复的情况。
三、局部因素
1.扁桃体隐窝引流不畅：
扁桃体表面有许多隐窝，正常情况下隐窝内会有一些脱落的上皮细胞、淋巴细胞等，但如果隐窝口堵塞，如受到炎症水肿、细菌或病毒等病原体感染后的分泌物堵塞等情况，就会导致隐窝内的病原体难以排出，长期滋生繁殖，从而引发扁桃体炎，并且容易反复。例如，当扁桃体受到急性炎症刺激时，隐窝口周围的组织水肿，可能会堵塞隐窝，使得隐窝内的环境有利于病原体的生长，进而导致扁桃体炎反复发作。
2.邻近器官炎症蔓延：
如鼻炎、鼻窦炎等疾病，鼻腔内的炎症可以通过后鼻孔蔓延至扁桃体部位，引发扁桃体炎。因为鼻腔和扁桃体部位在解剖上是相邻的，鼻腔内的病原体及其分泌物容易扩散到扁桃体区域。例如，鼻窦炎患者鼻腔内的脓性分泌物可能会逆流至扁桃体，刺激扁桃体引发炎症反应，如果鼻窦炎本身没有得到有效控制，就容易导致扁桃体炎反复发生。另外，咽炎也可能蔓延至扁桃体，咽部的炎症可以直接波及扁桃体，引起扁桃体的炎症病变。
四、其他因素
1.不良生活方式：
吸烟：烟草中的尼古丁等有害物质会刺激扁桃体黏膜，降低扁桃体的局部抵抗力，使扁桃体容易受到病原体的侵袭。长期吸烟的人，扁桃体炎的发病风险相对较高，并且即使发病后也较难痊愈，容易出现反复的情况。例如，有研究发现，长期吸烟者的扁桃体组织学改变较为明显，炎症反应相对更严重且容易反复。
饮酒：过量饮酒会损伤人体的免疫系统，影响人体的免疫功能，同时酒精对扁桃体黏膜也有刺激作用，容易导致扁桃体炎的发生。而且饮酒后人体的血液循环加快，可能会使病原体更容易在扁桃体部位定植繁殖，从而增加扁桃体炎反复的几率。
2.气候因素：
季节交替时，气温变化较大，如果不能及时增减衣物，人体容易受凉，导致上呼吸道黏膜血管收缩，局部抵抗力下降，从而容易引发扁桃体炎。例如，在秋冬季节，气温较低，人体呼吸道的防御功能会受到一定影响，此时扁桃体炎的发病率相对较高，并且容易出现反复的情况。在寒冷干燥的环境中，空气湿度较低，也会对扁桃体黏膜产生刺激，使得扁桃体的防御能力下降，增加病原体感染的机会。
