太田痣形成主要与胚胎发育中黑素细胞迁移异常有关，部分患者有家族遗传倾向，胚胎发育阶段调控机制紊乱会致黑素细胞异常分布，不同年龄性别形成机制无本质差异，正常生活方式不直接致太田痣，孕妇接触有害物质等可能增加风险，有家族病史人群后代发病概率升高。
太田痣的形成主要与胚胎发育过程中的黑素细胞迁移异常有关。在胚胎发育的早期，黑素细胞从神经嵴向表皮移行的过程中，部分黑素细胞未能按时到达表皮，而是滞留在了真皮层内，随着时间的推移，这些异常分布的黑素细胞就逐渐形成了太田痣。
从遗传学角度来看，有研究表明太田痣可能与遗传因素相关，部分患者存在一定的家族遗传倾向，但目前具体的遗传模式还不是完全清晰明确。
在胚胎发育的不同阶段，黑素细胞的迁移过程受到多种因素的调控，如果这些调控机制出现紊乱，就容易导致黑素细胞的异常分布。例如，在某些特定的基因表达异常等情况下，可能会干扰黑素细胞正常的迁移路径，使得本该到达表皮的黑素细胞滞留在真皮层，进而逐步发展形成太田痣。
对于不同年龄、性别的人群来说，太田痣的形成机制并无本质差异，但在实际的发病情况中，可能在某些年龄段或性别群体中相对更易出现相关表现。比如在儿童时期，由于身体处于生长发育阶段，胚胎发育相关的调控机制如果出现小的偏差就可能引发太田痣；而在生活方式方面，一般认为正常的生活方式本身不会直接导致太田痣的形成，但如果存在一些可能影响胚胎发育的特殊生活方式因素，如孕妇在孕期接触某些可能干扰胚胎发育的有害物质等情况，虽然这种情况相对较少见，但也可能在一定程度上增加胎儿出现太田痣的风险。对于有太田痣家族病史的人群，其后代发生太田痣的概率相对普通人群会有所升高，需要在孕期及孩子成长过程中更加关注皮肤等方面的发育情况。
