食管倒流症的发生与多种因素相关，包括食管下括约肌功能障碍、食管清除作用降低、胃排空延迟、腹腔压力增高以及食管黏膜屏障功能下降，如激素变化、某些药物可致食管下括约肌松弛，老年人或患神经系统疾病者食管蠕动障碍致清除反流物速度减慢，糖尿病、暴饮暴食致胃排空延迟，重体力劳动、频繁咳嗽、肥胖使腹腔压力增高，长期饮酒、吸烟等使食管黏膜屏障功能下降等，这些因素均易引发食管倒流症或加重其症状。
一、食管下括约肌功能障碍
食管下括约肌是食管末端与胃相连处的一组肌肉，正常情况下它能阻止胃内容物反流至食管。当食管下括约肌压力降低时，就容易发生食管倒流症。例如，某些激素变化（如妊娠时孕激素水平升高可能影响食管下括约肌功能）、某些药物（如硝酸甘油、钙通道阻滞剂等）可导致食管下括约肌松弛，从而使胃内容物更容易反流进入食管。
二、食管清除作用降低
食管的正常蠕动可以将反流至食管的内容物及时清除。如果食管蠕动功能出现障碍，比如老年人食管蠕动能力本身下降，或者患有某些神经系统疾病影响食管蠕动，就会导致食管清除反流物的速度减慢，使得反流物在食管内停留时间延长，增加食管倒流症的发生风险。
三、胃排空延迟
胃排空速度减慢时，胃内食物和胃酸等物质积聚，胃内压力升高，当压力超过食管下括约肌压力时，就容易引发反流。例如，糖尿病患者常伴有自主神经病变，可能影响胃的排空功能；另外，一些不良的生活方式，如暴饮暴食，也会导致胃排空延迟，进而增加食管倒流症的发生几率。
四、腹腔压力增高
长期从事重体力劳动、频繁剧烈咳嗽、肥胖等情况会使腹腔压力增高。腹腔压力增高会对胃部产生较大的压力，促使胃内容物向食管方向反流。比如肥胖人群，腹部脂肪堆积较多，腹腔内压力相对较高，更容易出现食管倒流现象。
五、食管黏膜屏障功能下降
食管黏膜本身具有一定的屏障功能，可以抵御反流物的损伤。但当一些因素导致食管黏膜屏障功能下降时，如长期大量饮酒、吸烟等，反流物中的胃酸、胃蛋白酶等更容易损伤食管黏膜，引发食管倒流症相关的炎症等病变，同时也会加重食管倒流的不适症状。例如，长期吸烟的人，烟草中的有害物质会损害食管黏膜的屏障结构和功能。
