肠镜可检查出多种疾病，包括肠道炎症性疾病如溃疡性结肠炎（肠镜下见结肠黏膜弥漫充血水肿、多发浅溃疡等）、克罗恩病（肠道黏膜铺路石样改变、纵行溃疡等）；肠道息肉（能发现各种息肉并可摘除小息肉送病理）；肠道肿瘤如结肠癌（肠道内菜花样等肿瘤）、直肠癌（直肠部位肿瘤表现）；肠道寄生虫感染（可直接观察到寄生虫）；肠道血管性疾病如肠道血管畸形（肠道黏膜异常血管团）、缺血性肠炎（肠道黏膜充血水肿糜烂等）。
肠道炎症性疾病
溃疡性结肠炎：肠镜下可见结肠黏膜弥漫性充血、水肿，多发性浅溃疡形成，病变多从直肠开始，逐渐向近段蔓延。通过肠镜可以直接观察到肠道黏膜的炎症表现，还能取组织进行病理检查以明确诊断。对于不同年龄的患者，溃疡性结肠炎的表现可能有所差异，但肠镜检查都是重要的诊断手段。例如，在儿童患者中，也可通过肠镜观察肠道黏膜的改变来辅助诊断溃疡性结肠炎。
克罗恩病：肠镜下可见肠道黏膜呈铺路石样改变，纵行溃疡，病变呈节段性分布。克罗恩病的病程较长，病情容易反复，肠镜检查有助于明确肠道病变的部位和范围，对疾病的诊断和病情评估具有重要意义。不同生活方式的人群都可能患克罗恩病，通过肠镜检查可以清晰地看到肠道的病变特征。
肠道息肉
肠镜能够发现肠道内的各种息肉，包括腺瘤性息肉、增生性息肉等。腺瘤性息肉有一定的癌变倾向，通过肠镜可以直接摘除较小的息肉进行治疗，并将息肉组织送病理检查以确定其性质。对于有家族息肉病史的人群，肠镜检查更为重要，因为这类人群患肠道息肉及相关疾病的风险较高，通过定期肠镜检查可以早期发现息肉并处理，预防癌变。
肠道肿瘤
结肠癌：肠镜下可见肠道内有菜花样、溃疡型等形态的肿瘤，表面常伴有糜烂、出血等表现。通过肠镜可以获取肿瘤组织进行病理活检，明确肿瘤的良恶性。不同年龄的人群结肠癌的发病率有所不同，一般随着年龄增长发病率升高。对于有结肠癌家族史、长期高脂肪低纤维饮食等生活方式的人群，肠镜检查是早期发现结肠癌的重要手段。
直肠癌：肠镜下可观察到直肠部位的肿瘤，表现为肠腔狭窄、肿物突出等。直肠癌的诊断主要依靠肠镜检查及病理活检，早期发现并治疗直肠癌对于提高患者的生存率至关重要。对于有便血、排便习惯改变等症状的人群，应及时进行肠镜检查以排除直肠癌的可能。
肠道寄生虫感染：某些肠道寄生虫，如蛔虫、绦虫等感染时，肠镜下可直接观察到寄生虫的存在，有助于明确诊断并进行相应的治疗。对于生活在卫生条件较差地区或有生食习惯的人群，肠道寄生虫感染的风险较高，肠镜检查可以帮助发现是否存在寄生虫感染及感染的部位等情况。
肠道血管性疾病
肠道血管畸形：肠镜下可见肠道黏膜有异常的血管团，表现为红色或紫红色的病变。通过肠镜检查可以明确血管畸形的部位和范围，对于诊断和治疗肠道血管畸形具有重要意义。不同年龄和生活方式的人群都可能发生肠道血管畸形，肠镜检查是发现该病的有效方法。
缺血性肠炎：肠镜下可见肠道黏膜充血、水肿、糜烂，严重时可出现溃疡等表现，多发生在肠道的特定部位，如左半结肠等。对于有动脉硬化、低血压等病史的人群，发生缺血性肠炎的风险较高，肠镜检查可以帮助诊断缺血性肠炎并评估病情的严重程度。
