一侧肾萎缩的治疗效果取决于病因、病程及肾功能受损程度，部分早期可逆病因可改善病情，但多数晚期萎缩肾脏难以完全恢复。
肾萎缩是指肾脏体积缩小、功能减退，常见病因包括先天性发育异常、肾动脉狭窄、慢性肾盂肾炎、尿路梗阻等。如果为早期肾动脉狭窄导致的缺血性萎缩，通过介入治疗（如支架植入）或外科手术解除血管狭窄，恢复肾脏血流，可部分逆转萎缩；尿路梗阻（如结石、肿瘤压迫）引起者，及时解除梗阻后，肾功能也可能有所改善。
然而，对于慢性肾盂肾炎、先天性肾发育不良等导致的肾萎缩，由于肾单位已发生不可逆损伤，治疗主要目的是延缓病情进展，保护健侧肾功能。治疗措施包括控制血压（目标值＜130/80mmHg）、减少蛋白尿、避免肾毒性药物，以及针对原发病治疗。此外，如果萎缩肾脏反复感染、出血或怀疑恶变，可考虑手术切除。
