圆锥角膜与遗传因素、角膜胶原代谢异常、眼部发育相关因素有关，遗传方面某些基因如TGFBI基因突变与发病关联，家族有病史者需密切关注；角膜胶原代谢异常致胶原纤维排列紊乱、强度下降；眼部发育中青春期发育迅速易致角膜生长不均衡，部分患者有先天性眼部发育异常基础。
一、遗传因素相关
圆锥角膜具有一定的遗传倾向，研究发现某些基因的突变或异常可能与圆锥角膜的形成有关。例如，有研究表明位于染色体1p36区域的TGFBI基因的突变与圆锥角膜的发病存在关联，携带特定突变基因的个体患圆锥角膜的风险相对较高。这种遗传因素在有家族病史的人群中体现得更为明显，若家族中有圆锥角膜患者，其他家庭成员尤其是直系亲属需要更加密切关注眼部健康状况，定期进行眼部检查，以便早期发现可能出现的圆锥角膜相关问题。
二、角膜胶原代谢异常方面
角膜的正常结构和功能依赖于胶原纤维的有序排列和正常代谢。在圆锥角膜患者中，存在角膜胶原代谢异常的情况。角膜基质中的Ⅰ型和Ⅴ型胶原含量及比例可能发生改变，导致角膜胶原纤维的排列紊乱，强度下降，使得角膜逐渐变薄并向前呈锥形突出。这种胶原代谢的异常可能涉及到多种因素，包括一些酶的活性改变等，例如基质金属蛋白酶等相关酶类的异常表达或活性变化，会影响胶原的合成与降解平衡，进而促使圆锥角膜的形成。对于处于生长发育阶段的青少年来说，身体的代谢活动较为活跃，胶原代谢的微小异常可能更容易累积并引发圆锥角膜，因此青少年群体需要特别注意眼部健康的维护。
三、眼部发育相关因素
1.青春期发育影响：在青春期，人体的生长发育较为迅速，包括眼部的发育。此阶段角膜的生长可能会出现不均衡等情况，容易导致圆锥角膜的发生。例如，青春期身体的激素水平变化可能会对角膜的生长代谢产生影响，使得角膜在这个时期更容易出现结构上的异常改变，从而增加圆锥角膜的发病风险。处于青春期的青少年要定期进行眼部检查，以便及时发现眼部的细微变化。
2.先天性因素：部分圆锥角膜患者可能存在先天性的眼部发育异常，例如角膜先天性的厚薄不均等情况，这使得角膜在出生后就存在潜在的发病基础，随着年龄的增长，在各种因素的作用下，逐渐发展为圆锥角膜。对于有先天性眼部发育异常家族史的新生儿及婴幼儿，家长要密切关注其眼部发育情况，在婴幼儿时期就开始关注眼部健康，一旦发现异常及时就医检查。
