功能性消化不良部分患者会引起消瘦，原因包括消化吸收障碍方面，儿童和老年人因自身胃肠功能特点，消化吸收不良易消瘦，患者因症状进食量少、营养物质不能有效利用致能量亏空消瘦；心理因素方面，女性易受相关心理因素影响，长期病史会加重心理负担及对消化功能负面影响，进而导致消瘦
消化吸收障碍方面：
年龄因素：儿童若患功能性消化不良，由于其处于生长发育阶段，胃肠功能本就相对脆弱，消化吸收不良会更明显地影响营养物质的摄取。例如，儿童的胃肠道消化酶分泌可能相对不足，功能性消化不良时这种不足会进一步加剧，导致食物中的蛋白质、脂肪、碳水化合物等营养物质不能被充分消化分解为可吸收的小分子物质，如蛋白质不能被分解为氨基酸，脂肪不能被分解为脂肪酸和甘油等，从而影响营养的吸收，长期下来就容易引起消瘦。而老年人患功能性消化不良时，其胃肠蠕动功能减退，消化液分泌减少，也会影响食物的消化吸收，且老年人本身机体代谢处于缓慢状态，对营养物质的需求相对稳定，但吸收减少会导致能量和营养物质供应不足，进而出现消瘦。
营养物质摄入与利用：功能性消化不良患者常存在早饱、餐后饱胀、上腹痛等症状，这些症状会影响患者的进食量。比如患者可能因早饱感而每餐进食量明显减少，长期如此导致总能量摄入不足。而且即使进食，由于消化功能障碍，食物中的营养物质不能被有效利用。以碳水化合物为例，正常情况下碳水化合物在胃肠内被消化为葡萄糖后被吸收进入血液，为机体提供能量，但功能性消化不良患者对碳水化合物的消化吸收受阻，不能将其有效转化为能量供机体利用，机体长期处于能量亏空状态，就会消耗自身储存的脂肪和蛋白质来提供能量，从而导致体重下降、消瘦。
心理因素方面：
性别与生活方式影响：女性相对男性可能更易受功能性消化不良相关心理因素的影响。一些女性患者可能因功能性消化不良带来的不适症状，如长期的上腹部不适等，产生焦虑、抑郁等情绪。而不良的生活方式，如长期熬夜、精神压力大等，会进一步加重这种心理状态。焦虑和抑郁情绪会影响神经内分泌系统，进而影响胃肠蠕动和消化液分泌，形成恶性循环，导致消化功能进一步紊乱，影响营养物质的消化吸收，最终引起消瘦。例如，长期焦虑的女性患者，其体内的肾上腺素等应激激素分泌增加，会抑制胃肠蠕动和消化酶的分泌，使食物在胃肠内停留时间延长，消化不充分，营养吸收减少。
病史对心理的累积影响：如果患者有长期的功能性消化不良病史，长期的身体不适会给患者带来较大的心理负担。病史越长，这种心理影响可能越严重，进而对消化功能的负面影响也越显著，更容易导致消瘦。比如一位患有功能性消化不良病史长达数年的患者，长期被疾病困扰，心理上可能更加焦虑、抑郁，进一步加重消化功能的紊乱，使得营养吸收持续不良，消瘦情况可能逐渐加重。
