桥本甲状腺炎发病与遗传、自身免疫、环境等因素相关。遗传方面具一定易感性，特定基因变异及家族史影响发病风险；自身免疫因素是关键，免疫系统错误攻击甲状腺组织，抗体升高致损伤，年龄、性别、生活方式及自身免疫病病史等影响；环境因素中，病毒感染可触发自身免疫反应，过量辐射损伤甲状腺组织诱发疾病，不同年龄人群受不同影响。
自身免疫因素
人体的免疫系统错误地将甲状腺组织当作外来的“敌人”进行攻击，是桥本甲状腺炎发病的关键自身免疫机制。正常情况下，免疫系统能够识别自身组织和外来抗原，但是在某些因素作用下，甲状腺自身的抗原被免疫系统识别为非自身物质，从而引发自身免疫反应。例如，甲状腺过氧化物酶抗体（TPOAb）和甲状腺球蛋白抗体（TgAb）等自身抗体水平升高，这些抗体攻击甲状腺细胞，导致甲状腺组织损伤和炎症。自身免疫因素的发生与多种情况相关，年龄方面，不同年龄段都可能因为自身免疫调节失衡而发病，儿童时期免疫系统尚在发育过程中，也可能出现自身免疫调节异常引发桥本甲状腺炎；性别上女性相对更易出现自身免疫相关的异常，可能与女性的内分泌环境等因素有关；生活方式中长期的不良生活习惯，如过度劳累、缺乏运动等可能影响自身免疫功能，增加自身免疫攻击甲状腺组织的风险；有自身免疫性疾病病史的人群，如系统性红斑狼疮等，患桥本甲状腺炎的风险也会升高。
环境因素
感染因素：某些病毒感染可能与桥本甲状腺炎的发病有关。例如，柯萨奇病毒、EB病毒等感染可能触发自身免疫反应，导致甲状腺组织受损。不同年龄人群对病毒感染的易感性不同，儿童免疫系统相对较弱，更容易受到病毒感染的影响，从而增加患桥本甲状腺炎的风险；生活在病毒感染高发地区或者经常接触病毒感染源的人群，发病风险可能升高；感染发生后，如果不能及时有效控制，可能持续刺激免疫系统，引发针对甲状腺的自身免疫攻击。
辐射因素：长期接受过量的放射性辐射，如颈部放疗等，会损伤甲状腺组织，破坏甲状腺细胞的正常结构和功能，进而诱发桥本甲状腺炎。不同年龄人群对辐射的敏感性不同，儿童时期甲状腺处于相对活跃的发育阶段，受到辐射影响后更易引发甲状腺相关疾病；生活或工作环境中如果存在放射性物质暴露风险，如核电站周边等区域的人群，需要更加注意防范辐射对甲状腺的损伤；有颈部放疗病史的人群，患桥本甲状腺炎的概率会显著增加。
