食管反流由多种因素共同作用引起，包括食管下括约肌功能障碍、食管清除作用降低、胃排空延迟、食管黏膜屏障功能下降，还涉及年龄、性别、生活方式、病史等其他因素，如婴幼儿和老年人因生理特点易患，妊娠女性因激素变化发生率高，长期高脂饮食、暴饮暴食等生活方式及患胃肠道或食管疾病等病史会增加风险。
一、食管下括约肌功能障碍
食管下括约肌是食管末端与胃连接部位的一组肌肉，正常情况下它能起到单向阀门的作用，防止胃内容物反流至食管。当食管下括约肌压力降低时，就容易引发食管反流。例如，某些激素变化（如妊娠时孕激素水平升高）可能影响食管下括约肌的功能，使其张力下降；肥胖人群腹部脂肪堆积，会增加腹内压，进而影响食管下括约肌的正常功能；一些药物也可能导致食管下括约肌功能障碍，如钙通道阻滞剂等。
二、食管清除作用降低
正常情况下，食管会通过蠕动等方式将反流至食管的胃内容物及时清除。但当食管蠕动减慢或唾液分泌减少时，食管对反流物的清除能力就会降低。比如，老年人食管蠕动功能本身可能会有所减退，这就使得食管清除反流物的能力下降；干燥综合征患者由于唾液分泌减少，也会影响对反流物的清除，从而增加食管反流的发生风险。
三、胃排空延迟
胃排空速度减慢时，胃内食物积聚，胃内压力升高，更容易导致胃内容物反流至食管。常见于一些患有糖尿病等疾病的患者，糖尿病可引起胃轻瘫，影响胃的正常排空功能；此外，精神紧张、焦虑等情绪因素也可能通过影响自主神经功能，导致胃排空延迟，进而诱发食管反流。
四、食管黏膜屏障功能下降
食管黏膜本身具有一定的屏障功能，能够抵御胃酸等反流物的损伤。但当一些因素导致食管黏膜屏障功能下降时，就容易受到反流物的侵害并引发反流相关症状。例如，长期大量吸烟、饮酒会损伤食管黏膜，使食管黏膜屏障功能降低；某些刺激性食物（如过酸、过辣的食物）也可能破坏食管黏膜屏障，增加食管反流发生的可能性。
五、其他因素
年龄因素：婴幼儿食管下括约肌发育尚未完善，且食管较短、抗反流机制不成熟，相对更容易发生食管反流；老年人随着年龄增长，食管下括约肌功能减退、食管清除能力下降等，也是食管反流的高发人群。
性别因素：一般来说，在没有其他特殊疾病影响下，男女在食管反流的发生上没有显著的性别差异，但妊娠女性由于激素变化等原因，食管反流的发生率相对较高。
生活方式因素：长期高脂饮食会使胃内容物更容易反流；过度进食、暴饮暴食会增加胃内压力，促进反流发生；长期弯腰、负重等增加腹压的动作也可能诱发食管反流。
病史因素：患有某些胃肠道疾病（如胃溃疡、十二指肠溃疡等）、食管疾病（如食管裂孔疝等）的患者，发生食管反流的风险往往更高。食管裂孔疝会使食管下括约肌的结构发生改变，导致其功能异常，从而引发食管反流。
