肝管结石的引起因素包括胆道感染因素、胆道寄生虫因素、胆汁成分异常因素和胆道解剖结构异常因素。胆道感染时细菌等可促结石形成，儿童、老年人及有胆道病史者易受影响；胆道蛔虫症是重要原因，儿童因卫生习惯差风险相对高，有胆道蛔虫病史者易诱发；正常胆汁成分比例失调易致结石，各年龄段、男女及有肝胆基础疾病者易受不良生活方式等影响；胆道先天性狭窄或畸形等解剖结构异常致胆汁引流不畅淤积成石，儿童先天异常常见，后天外伤致结构异常的成年人易发病，有胆道解剖结构异常病史者易形成结石。
一、胆道感染因素
细菌感染相关：胆道感染时，细菌及其产生的毒素等物质可作为核心，促使胆红素钙等成分沉积形成结石。例如，大肠杆菌等常见致病菌感染胆道后，会改变胆道内的微环境，影响胆汁中各种成分的平衡，增加结石形成的风险。从年龄角度看，儿童时期如果胆道发生感染，由于其胆道系统相对脆弱，感染更容易引发胆汁成分的改变，进而增加肝管结石形成几率；对于老年人，身体机能衰退，免疫功能下降，胆道感染的易感性增加，也是肝管结石形成的一个潜在因素。性别方面，目前并无明确证据表明男女在胆道感染引发肝管结石的风险上有显著差异，但不同性别在生活方式等方面的差异可能间接影响感染发生的频率，从而与肝管结石形成相关。生活方式上，不注意饮食卫生、长期处于不洁净的生活环境等都可能增加胆道感染的机会，进而促进肝管结石形成。有胆道病史的人群，本身胆道结构或功能已存在一定异常，再次发生感染时更易导致胆汁成分紊乱，引发肝管结石。
二、胆道寄生虫因素
蛔虫感染影响：胆道蛔虫症是导致肝管结石的重要原因之一。蛔虫进入胆道后，其虫体、虫卵等可作为结石的核心，同时蛔虫感染会引起胆道炎症，改变胆汁的理化性质，使得胆汁中的胆盐、胆固醇等成分比例失调，促进结石形成。在年龄方面，儿童由于卫生习惯相对较差等因素，蛔虫感染相对多见，因此儿童患肝管结石因蛔虫因素引发的风险相对较高；对于老年人，蛔虫感染相对较少，但如果有过胆道蛔虫病史，再次发作时仍容易引发结石相关问题。性别差异上，目前没有明显证据显示男女因蛔虫感染导致肝管结石的风险有差异，但不同性别在卫生习惯等生活方式上的不同可能影响蛔虫感染的概率。生活方式中，不良的卫生习惯，如饭前便后不洗手等，会增加蛔虫感染的可能，进而与肝管结石形成相关。有胆道蛔虫病史的人群，胆道内环境已经受到过蛔虫的影响，再次出现蛔虫相关情况时更易诱发肝管结石。
三、胆汁成分异常因素
胆盐、胆固醇与胆红素比例失调：正常胆汁中胆盐、胆固醇、胆红素等成分保持相对稳定的比例。当这个比例失调时，就容易形成结石。例如，胆固醇含量过高或胆盐、胆红素含量相对不足时，胆固醇就容易析出形成结石核心。从年龄角度，不同年龄段胆汁成分的代谢特点不同，儿童时期胆汁代谢功能尚不完善，更容易出现成分比例失调的情况；老年人胆汁分泌和代谢功能衰退，也容易导致胆汁成分比例改变，增加肝管结石形成风险。性别方面，虽然没有直接证据表明男女胆汁成分比例失调在肝管结石形成上有性别差异，但女性在激素水平等方面的特点可能间接影响胆汁成分，比如孕期等特殊生理时期女性胆汁成分可能会有变化，从而与肝管结石形成相关。生活方式中，高脂饮食等不良生活方式会影响胆固醇的代谢，进而影响胆汁中胆固醇的含量，导致成分比例失调，增加肝管结石形成几率；长期饮酒等不良生活方式也可能干扰胆汁成分的稳定，促进结石形成。有肝胆系统基础疾病的人群，本身胆汁成分调节机制可能已经存在问题，更容易出现成分比例失调，引发肝管结石。
四、胆道解剖结构异常因素
胆道狭窄或畸形影响：胆道存在先天性狭窄或畸形等解剖结构异常时，会导致胆汁引流不畅，胆汁在胆道内淤积，胆汁中的成分就容易沉淀形成结石。比如先天性胆道狭窄，会使胆汁排出受阻，胆汁长时间淤积在肝管内，逐渐形成结石。年龄方面，先天性胆道解剖结构异常在儿童中可能更常见，儿童时期就可能因为这种结构异常而埋下肝管结石形成的隐患；对于成年人，如果是后天因外伤等因素导致胆道解剖结构异常，也会增加肝管结石形成风险。性别差异上，目前没有明确证据显示男女因胆道解剖结构异常引发肝管结石的风险有不同，但不同性别在身体发育等方面的差异可能对胆道解剖结构异常的影响程度有一定间接作用。生活方式中，不良的生活方式一般不会直接导致胆道解剖结构异常，但如果有胆道外伤等情况，不良生活方式可能会影响外伤的恢复等，间接与肝管结石形成相关。有胆道解剖结构异常病史的人群，本身胆道的正常引流等功能已经受到影响，更易发生胆汁淤积和结石形成。
