太田痣产生原因主要是遗传因素和胚胎发育异常，遗传因素致其有遗传倾向，胚胎发育早期神经嵴细胞异常移行停留在真皮层持续合成分泌黑素致发病，婴儿期可发现，无明显性别特异性，生活方式与直接产生关系不大，家族病史者需关注皮肤状况，胚胎发育异常暂无明确可预防生活方式干预措施。
遗传因素：大量的临床研究表明，太田痣具有一定的遗传倾向。研究发现，太田痣的发生与特定的基因位点相关。如果家族中有太田痣患者，那么其后代患太田痣的风险会相对增高。例如，有学者通过对多个太田痣患者家族的遗传学分析，发现存在某些基因的突变或变异与太田痣的遗传易感性密切相关。
胚胎发育异常：在胚胎发育的早期，神经嵴细胞向表皮移行的过程中发生了异常。正常情况下，神经嵴细胞会逐渐迁移到皮肤等部位并分化为正常的黑素细胞等。但在太田痣患者中，部分神经嵴细胞未能正常迁移，而是停留在了真皮层等部位，并且这些异常停留的神经嵴细胞持续合成和分泌黑素，从而导致了太田痣的形成。一般认为，这种胚胎发育过程中的异常可能发生在胚胎发育的特定阶段，如胚胎的第11周左右，此时神经嵴细胞的迁移过程出现紊乱，就可能引发太田痣。年龄方面，太田痣在婴儿期即可被发现，随着年龄增长可能会有一定变化，但遗传因素在不同年龄段的太田痣患者中都可能起到作用；性别差异上，男女均可发病，没有明显的性别特异性；生活方式一般与太田痣的直接产生关系不大，但不健康的生活方式可能会影响皮肤的状态间接影响对太田痣的观察等；对于有家族病史的人群，需要更加关注自身皮肤状况，定期进行皮肤检查；在胚胎发育异常方面，目前尚无明确的可预防的生活方式干预措施来避免这种异常的发生，主要还是基于对其发病机制的研究来进一步探索防治方法。
