手关节腱鞘囊肿成因包括长期劳损致肌腱与腱鞘摩擦退变、滑液失衡形成囊肿；手部急性外伤致腱鞘等受损修复异常形成囊肿；年龄增长致结缔组织黏液退行性变使腱鞘囊性改变形成囊肿；关节炎累及手部关节致滑膜渗出增多形成囊肿。
劳损因素：长期过度使用手关节进行重复性动作是常见诱因。例如，频繁打字、织毛衣、弹奏乐器等职业或生活行为，会使手部肌腱和腱鞘不断摩擦，导致腱鞘组织发生退变、水肿，进而引发腱鞘囊肿。长期的劳损会使腱鞘内的滑液分泌失衡，过多的滑液积聚在腱鞘内形成囊肿。以长期从事键盘输入工作的人群为例，手部关节长时间处于紧张状态，手指频繁屈伸，手部肌腱与腱鞘之间的摩擦增加，患手关节腱鞘囊肿的风险相对较高。
外伤因素：手部受到急性外伤，如扭伤、挫伤等，可能导致腱鞘、肌腱或关节囊受损，引起局部出血、渗出，后续组织修复过程中可能出现异常，导致腱鞘囊肿形成。比如，手部在运动中突然遭受外力撞击，使腱鞘结构受到破坏，内部组织液积聚，逐渐形成囊肿。青少年在进行剧烈运动时若手部受伤，就可能增加手关节腱鞘囊肿的发病几率。
结缔组织黏液退行性变：随着年龄增长，人体结缔组织会发生黏液退行性变，手部腱鞘等组织也不例外。这种退行性改变会使腱鞘内的黏液含量增加，导致局部出现囊性改变，进而形成腱鞘囊肿。中老年人由于身体机能衰退，结缔组织的黏液退行性变较为常见，所以手关节腱鞘囊肿在中老年人中的发生率相对较高。
关节炎影响：某些关节炎性疾病，如类风湿关节炎等，会累及手部关节，导致关节周围的腱鞘、滑膜等组织发生炎症反应，引起滑膜渗出增多，最终形成腱鞘囊肿。类风湿关节炎患者的免疫系统攻击自身关节组织，手部关节受到炎症侵袭，容易出现腱鞘囊肿等并发症。患有类风湿关节炎的人群，手部关节长期处于炎症状态，患手关节腱鞘囊肿的可能性会明显增加。
