非淋球菌性尿道炎由沙眼衣原体、解脲脲原体等病原体引起，男性有尿道分泌物、尿道不适及可能伴附睾炎等，女性尿道症状不典型、有阴道症状及可能累及盆腔等，儿童、妊娠期女性、老年人有各自特殊症状特点
男性症状
尿道分泌物：晨起时可见尿道外口有少量稀薄的浆液性或黏液性分泌物，有时仅表现为内裤污染，分泌物量相对淋球菌性尿道炎较少。部分患者分泌物较为黏稠，挤压尿道才可见少量分泌物溢出。
尿道不适：尿道有瘙痒感、刺痛感或灼热感等。病情较轻时可能仅感觉尿道轻微不适，病情较重时不适感较为明显，在排尿时症状可能会加重，影响正常的排尿体验。例如，患者可能会感觉排尿时尿道有明显的刺痛，导致排尿次数增多，出现尿频现象，但一般无明显的尿急、尿痛（与淋球菌性尿道炎不同，淋球菌性尿道炎尿急、尿痛症状通常较明显）。
其他：部分患者可能伴有附睾炎，出现附睾肿大、疼痛等症状，疼痛可放射至下腹部等部位。若病情迁延不愈，可能会影响生育功能等，这与病原体长期刺激尿道及生殖系统，导致生殖系统结构和功能改变有关，不同生活方式的男性可能因自身免疫力等差异，病情进展速度有所不同。
女性症状
尿道症状：多数女性患者尿道症状相对男性不典型，可能仅有轻度的尿道瘙痒、灼热感，部分患者可能无明显尿道不适症状。但部分患者会出现尿频、尿急等症状，不过一般程度较男性轻。
阴道症状：阴道分泌物增多，可为黏液性或脓性分泌物，白带性状发生改变，颜色可能发黄等。同时，阴道有瘙痒感，外阴也可能出现瘙痒不适，这是因为病原体感染阴道后，引起阴道局部的炎症反应，不同生活方式的女性，如卫生习惯较差、性生活频繁等，感染后阴道症状可能更明显。
其他：部分女性患者可能出现宫颈炎，表现为宫颈充血、水肿、有黏液脓性分泌物等。若病情累及盆腔，可能会出现下腹部疼痛等症状，尤其是在性生活后或月经期间，疼痛可能会加重。对于有生育需求的女性，病情若未得到有效控制，可能会影响受孕，增加流产等风险，这与病原体对生殖系统的破坏以及炎症环境对生殖细胞和着床环境的影响有关。
特殊人群症状特点
儿童：儿童非淋球菌性尿道炎相对少见，但若发生，症状可能不典型。女婴可能表现为外阴瘙痒、红肿，有分泌物等，由于儿童表达能力有限，可能仅表现为哭闹、搔抓外阴等行为异常。男童可能出现尿道分泌物、排尿不适等，但往往容易被忽视。这是因为儿童的生殖系统发育尚未成熟，免疫力相对较低，且卫生护理若不到位，更容易受到病原体侵袭，同时儿童无法准确表达自身的不适感受，导致症状发现较晚。
妊娠期女性：妊娠期女性患非淋球菌性尿道炎时，由于体内激素变化等因素，症状可能会有所不同。可能会出现尿道症状加重，同时对胎儿也可能产生影响，如增加早产、胎膜早破等风险。这是因为妊娠期女性的身体处于特殊的生理状态，免疫系统和生殖系统都有相应改变，病原体更容易在体内滋生繁殖，且炎症可能通过胎盘等途径影响胎儿的正常发育。
老年人：老年人患非淋球菌性尿道炎时，症状可能不典型，可能仅表现为轻度的尿频、尿急，尿道不适感不明显，容易被忽视而延误治疗。这与老年人的身体机能衰退，对炎症的反应不如年轻人敏感有关，同时老年人可能合并有其他基础疾病，如糖尿病等，会影响病情的发展和恢复。
