治疗支原体肺炎的常用药物包括大环内酯类抗生素（首选，如红霉素、阿奇霉素）、四环素类抗生素（如多西环素，儿童慎用）、氟喹诺酮类抗生素（如左氧氟沙星，18岁以下未成年人通常不推荐，用于成人特殊情况）；特殊人群中儿童优先选大环内酯类相对安全品种且严格掌握适应证，孕妇用要谨慎权衡选对胎儿影响小的大环内酯类，老年人要考虑肝肾功能调整剂量或选对其影响小的药物并监测指标。
大环内酯类抗生素：是治疗支原体肺炎的首选药物。例如红霉素，大量临床研究表明，红霉素对肺炎支原体有较好的抑制作用，能有效减轻支原体肺炎患者的临床症状，缩短病程。阿奇霉素也是常用的大环内酯类药物，其药代动力学特点使得它在体内能维持较长时间的有效药物浓度，同样对肺炎支原体有良好的抗菌活性。
四环素类抗生素：如多西环素等，也对肺炎支原体有一定的抗菌作用，但由于四环素类药物可能会影响儿童骨骼发育等问题，所以在儿童中的使用需要谨慎，一般多用于成人且无其他更好选择的情况。
氟喹诺酮类抗生素：比如左氧氟沙星等，不过由于儿童使用氟喹诺酮类药物可能会影响软骨发育，所以在18岁以下未成年人中通常不推荐使用，主要用于成人耐药或不耐受大环内酯类药物等特殊情况。
对于特殊人群，儿童患支原体肺炎时，应优先考虑大环内酯类药物中对儿童相对更安全的品种，但也需严格掌握适应证。孕妇患支原体肺炎时，使用药物需格外谨慎，因为一些药物可能会对胎儿产生影响，需要在医生综合评估孕妇病情和胎儿情况后，权衡利弊选择合适的药物，一般也会优先考虑对胎儿影响较小的大环内酯类药物。老年人患支原体肺炎时，要考虑其肝肾功能情况，因为药物主要通过肝肾代谢，所以需要调整药物剂量或选择对肝肾功能影响较小的药物，并密切监测肝肾功能指标。
