肺脓肿的发生与病原体感染、气道阻塞、血源性感染有关。病原体感染包括细菌（最常见厌氧菌，还有需氧菌、兼性厌氧菌，儿童青少年、老年人肺脓肿感染细菌有差异）、真菌、结核分枝杆菌等；气道阻塞有异物阻塞（儿童、成年人、老年人均可能发生）和肿瘤阻塞（多见于中老年人长期吸烟人群）；血源性感染是身体其他部位感染病灶病原菌经血液循环到肺部引发。
一、病原体感染
1.细菌感染
最常见的病原菌是厌氧菌，如消化链球菌、产黑色素拟杆菌等。这些厌氧菌多是来自口腔、咽部的正常菌群，当口腔卫生不良、吞咽功能障碍等情况时，口腔内的厌氧菌可被误吸入下呼吸道，导致细支气管阻塞，病原菌繁殖引起肺组织感染、坏死形成肺脓肿。例如，有研究表明，在肺脓肿患者中，约有70%-90%的病例与厌氧菌感染有关。此外，需氧菌和兼性厌氧菌也可引起肺脓肿，如金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、溶血性链球菌等。金黄色葡萄球菌可通过血源性播散引起肺脓肿，比如患者有皮肤感染（如疖、痈等）时，细菌可随血液循环到达肺部，引起肺部炎症、坏死形成脓肿；肺炎链球菌感染也可能引发肺脓肿，当机体抵抗力下降时，肺炎链球菌在肺部繁殖，破坏肺组织导致脓肿形成。
儿童和青少年肺脓肿中，金黄色葡萄球菌感染相对较为常见，可能与儿童的免疫系统发育尚未完全成熟，容易受到金黄色葡萄球菌等细菌的侵袭有关。而老年人肺脓肿可能与老年人常合并有口腔疾病、慢性阻塞性肺疾病（COPD）等基础疾病，导致呼吸道防御功能下降，易受到多种病原菌感染有关。
2.其他病原体感染
真菌也可引起肺脓肿，如曲霉菌等。当机体长期使用广谱抗生素、糖皮质激素，或存在免疫功能低下（如艾滋病患者、长期化疗患者等）时，容易继发真菌性肺脓肿。例如，艾滋病患者由于免疫系统严重受损，肺部容易受到曲霉菌等真菌的感染，引发肺脓肿。此外，结核分枝杆菌也可引起结核性肺脓肿，多是在肺结核的基础上，病灶内的结核分枝杆菌进一步破坏肺组织，导致脓肿形成。
二、气道阻塞
1.异物阻塞
吸入异物是导致气道阻塞进而引起肺脓肿的一个重要原因。例如，儿童由于好奇心强，容易将小玩具、豆类等异物吸入气道，异物阻塞细支气管后，远端肺组织分泌物引流不畅，细菌容易繁殖，引起肺部感染、坏死形成肺脓肿。成年人也可能因误吸食物残渣、呕吐物等导致气道阻塞，如醉酒、昏迷、吞咽功能障碍的患者容易发生误吸，进而引发肺脓肿。老年人如果存在牙齿脱落、吞咽反射迟钝等情况，也增加了误吸异物导致气道阻塞的风险。
2.肿瘤阻塞
支气管肺癌等肺部肿瘤可阻塞支气管，使远端肺组织内的分泌物难以排出，细菌在局部繁殖，引起肺组织感染、坏死形成肺脓肿。肿瘤阻塞导致的肺脓肿多见于中老年人，尤其是有长期吸烟史的人群。因为长期吸烟会损伤呼吸道黏膜，降低呼吸道的防御功能，同时烟草中的有害物质可能诱发肺部肿瘤，进而引发肺脓肿。例如，长期吸烟的患者如果出现咳嗽、咳痰加重，且经抗感染治疗效果不佳时，需警惕肿瘤阻塞气道引起肺脓肿的可能。
三、血源性感染
身体其他部位的感染病灶中的病原菌可通过血液循环到达肺部，引起肺脓肿。常见的情况如皮肤创伤感染、疖、痈、骨髓炎等，病原菌可进入血液循环，随血流到达肺部，引起肺部小血管栓塞，导致肺组织化脓性炎症、坏死形成脓肿。例如，皮肤疖肿中的金黄色葡萄球菌可通过血行播散至肺部，引发血源性肺脓肿。这种情况在免疫力较低的人群中更易发生，如糖尿病患者、长期使用免疫抑制剂的患者等，因为他们的机体抵抗力较弱，病原菌更容易在血液循环中定植并引起肺部感染。
