反流性咽喉炎有多种症状，咽喉部相关症状包括咽喉异物感（与反流刺激黏膜致肿胀、神经末梢受刺激有关，长期不良生活方式及有胃病史人群易出现）、声音嘶哑（反流致喉部黏膜水肿等，儿童、女性有其特殊情况）、咽喉疼痛（程度不一，儿童、老年人有不同表现）；呼吸道相关症状有咳嗽（刺激咽喉及气道引起，不同年龄段表现有差异）、气喘（少数患者有，有基础呼吸道疾病者可能加重）；其他症状包括清嗓动作频繁（可加重黏膜损伤）、部分患者有反酸烧心（部分仅咽喉症状易被忽视，老年人易有无典型反酸烧心表现）。
咽喉异物感：患者常感觉咽喉部有异物，咳之不出，咽之不下，这是较为常见的症状之一。其发生机制可能与反流的胃酸等刺激咽喉部黏膜，导致黏膜肿胀、神经末梢受刺激有关。不同年龄、性别人群均可出现，长期不良生活方式如频繁进食、餐后立即平卧等可能增加发生异物感的风险，有胃病史的人群更易出现该症状。
声音嘶哑：反流的胃酸等刺激喉部黏膜，可引起喉部黏膜水肿、声带运动障碍等，从而导致声音嘶哑。儿童患者若出现反流性咽喉炎导致的声音嘶哑，需特别注意其发声习惯等因素，长期声音嘶哑可能影响儿童的语言发育等；女性在生理期等特殊时期，激素水平变化可能对喉部黏膜状态有一定影响，从而影响声音嘶哑的表现及恢复。
咽喉疼痛：反流的酸性物质刺激咽喉部黏膜，可引起咽喉部疼痛，疼痛程度可轻可重。年龄较小的儿童可能无法准确表达疼痛，但会出现哭闹、拒食等表现；老年人由于机体敏感性等因素，疼痛感知可能与年轻人有所不同，且需警惕是否合并其他疾病导致的疼痛与之混淆。
呼吸道相关症状
咳嗽：是反流性咽喉炎常见的呼吸道症状之一。反流物刺激咽喉部及气道，可引起咳嗽反射。咳嗽特点多样，有的为刺激性干咳，有的可能伴有少量痰液。不同年龄段人群咳嗽表现略有差异，儿童咳嗽可能影响其日常活动及睡眠；长期吸烟者因本身呼吸道黏膜已有损伤，发生反流性咽喉炎时咳嗽症状可能更明显。
气喘：少数反流性咽喉炎患者可能出现气喘症状，这是由于反流物刺激气道，引起气道痉挛等改变所致。对于有基础呼吸道疾病如哮喘等的患者，合并反流性咽喉炎时气喘症状可能加重，需特别注意两者的鉴别诊断及综合治疗。
其他症状
清嗓动作频繁：患者因咽喉部不适，会频繁做出清嗓动作，试图缓解异物感等不适。这种频繁清嗓可能进一步加重咽喉部黏膜的损伤，形成恶性循环。不同生活方式人群清嗓动作频繁程度不同，例如长期用声过度的人群，如教师等，本身咽喉部已有一定程度的疲劳，合并反流性咽喉炎时清嗓动作可能更频繁。
反酸、烧心（部分患者有）：部分反流性咽喉炎患者同时伴有反酸、烧心症状，这是因为胃内容物反流至食管甚至口腔，刺激相关部位引起的。但也有部分患者可能仅有咽喉部症状而无典型的反酸、烧心表现，容易被忽视，从而延误诊断。老年人由于食管下括约肌功能减退等因素，更容易出现无典型反酸、烧心的反流性咽喉炎表现。
