肛窦炎症状包括肛门疼痛（多为刺痛或灼痛，排便时加剧，不同人群表现有别，特定生活方式人群易反复）、肛门坠胀感（有下坠感伴便意难排，久坐久站加重，不同人群表现有差异）、分泌物增多（炎症致腺体分泌增加致肛门潮湿不适，不良生活方式者易出现）、瘙痒（分泌物刺激致瘙痒，搔抓可致破损继发感染，过敏体质者易出现）、排便异常（有排便习惯及粪便形状改变，未有效治疗者加重，有基础疾病者更难控制）。
肛门疼痛：多为刺痛或灼痛，排便时由于粪便刺激发炎的肛窦，疼痛会加剧。尤其是在排便初期，粪便刚通过肛窦部位时，疼痛较为明显。不同年龄、性别人群表现可能无明显差异，但儿童可能因表达不清而表现出哭闹不安等情况。对于有长期便秘或腹泻等生活方式问题的人群，因肠道刺激因素持续存在，肛门疼痛可能更易反复出现。
肛门坠胀感：患者常感觉肛门有下坠感，仿佛总有便意，但去厕所又排不出多少粪便。这种坠胀感在久坐、久站后可能会加重。老年人由于身体机能下降，肛门周围肌肉等组织功能可能有所减退，肛门坠胀感可能相对更明显；而年轻女性在月经周期等特殊时期，激素水平变化可能对肛门周围组织产生一定影响，也可能使肛门坠胀感有所变化。
分泌物增多：炎症刺激肛窦，导致腺体分泌增加，可出现肛门分泌物增多的情况，分泌物可随粪便排出或自行流出肛门外，使肛门周围潮湿不适。生活不规律、长期熬夜等不良生活方式的人群，自身免疫力可能降低，更易出现分泌物增多的现象。
瘙痒：肛门周围因分泌物刺激，可引起瘙痒不适，患者常不自觉地搔抓肛门周围皮肤。如果搔抓过度导致皮肤破损，还可能继发感染等情况。过敏体质的人群可能对分泌物等物质更敏感，更容易出现肛门瘙痒症状。
排便异常：部分患者可出现排便习惯改变，如便秘或腹泻，也可能出现粪便形状改变，如粪便变细等。长期患有肛窦炎且未得到有效治疗的患者，肠道功能可能受到一定影响，进而导致排便异常情况加重。患有糖尿病等基础疾病的人群，由于自身代谢等方面的问题，排便异常可能更难控制，需要更加关注肛窦炎的相关症状并积极处理。
