指甲出现小坑可能由多种因素引起，包括甲营养不良（缺乏维生素、微量元素或患某些全身性疾病等）、真菌感染（皮肤癣菌感染等）、外伤（指甲受砸压等损伤）、皮肤病累及指甲（斑秃、湿疹等影响）以及其他因素（系统性疾病、长期接触化学物质等），不同因素在年龄、性别、生活方式等方面有不同影响。
一、甲营养不良
1.成因：多种因素可导致甲营养不良，如缺乏维生素（像维生素A、B族维生素等）、微量元素（锌等），或是患有某些全身性疾病影响了甲的正常生长，常见于患有银屑病、扁平苔藓等皮肤病的患者，这些疾病会干扰甲母质的功能，从而使指甲出现小坑等改变。从科学研究来看，长期营养不良的人群，其指甲发生形态改变的概率会显著增加，其中指甲有小坑是常见表现之一。
2.影响因素：年龄方面，儿童如果挑食、偏食，容易出现维生素和微量元素缺乏，进而引发甲营养不良；成年人长期饮食不均衡、过度节食减肥等也易导致此类情况。性别上无明显差异，但不同生活方式人群发生概率不同，比如长期素食者、过度追求减肥且饮食结构单一的人群更易缺乏相关营养成分而出现甲营养不良。有慢性病史如胃肠道疾病影响营养吸收的人群，甲营养不良的风险更高。
二、真菌感染（甲癣）
1.成因：皮肤癣菌等真菌感染甲板和甲下组织可引起甲癣，真菌在甲板内生长繁殖，会破坏甲的正常结构，导致指甲出现凹陷、增厚、变色等改变，其中小坑是常见表现之一。研究表明，在潮湿环境工作、与他人共用拖鞋等个人物品的人群，感染真菌引发甲癣的几率较高，进而容易出现指甲有小坑的情况。
2.影响因素：年龄上，儿童相对免疫力较好，感染概率低于成年人，但如果接触了感染源也可能发病；成年人中，男性由于从事一些容易接触感染源工作的概率相对稍高。生活方式方面，经常穿不透气鞋子、脚部多汗的人群，利于真菌滋生，增加甲癣发病风险，从而出现指甲小坑。有手足癣病史的人群，自身携带真菌，更容易引发甲癣导致指甲出现小坑。
三、外伤
1.成因：指甲受到外伤，如被重物砸到、挤压等，会导致甲母质或甲床受损，进而影响指甲的正常生长，出现小坑等形态改变。例如手指被门夹到、踢到硬物等情况，都可能造成指甲局部损伤，使得新生长的指甲出现凹陷小坑。
2.影响因素：年龄较小的儿童活泼好动，更容易发生外伤导致指甲出现小坑；成年人在工作或生活中如果不注意保护手指，也容易受到外伤。男性从事一些体力劳动或有剧烈运动的人群，发生手指外伤的概率相对较高，女性如果从事精细工作但不小心也可能出现指甲外伤。生活方式中，参与一些有一定危险性活动的人群，如运动爱好者在激烈运动中、建筑工人在工作时等，指甲外伤风险增加，易出现指甲小坑。
四、皮肤病累及指甲
1.成因：一些自身免疫性皮肤病或其他皮肤病可累及指甲，如斑秃患者约有50%会出现甲损害，表现为指甲有小凹点等改变；湿疹也可能影响指甲周围皮肤，进而波及指甲，导致指甲出现小坑。这是因为这些皮肤病会影响甲周皮肤的微环境以及甲母质的功能，从而引起指甲形态异常。
2.影响因素：年龄上，斑秃在各年龄段均可发病，儿童和成年人都可能出现；湿疹则在各年龄段都有发生。性别差异不明显，生活方式中，精神压力大的人群容易诱发斑秃等自身免疫性疾病，从而增加指甲出现小坑的风险；长期处于潮湿、接触刺激性物质环境中的人群，湿疹发病概率高，进而可能影响指甲。有自身免疫性疾病家族史的人群，患相关累及指甲皮肤病的风险更高。
五、其他因素
1.成因：某些系统性疾病，如雷诺病，患者指甲可能出现缺血改变，表现为小坑；还有长期接触某些化学物质，如指甲油中的有害成分、工业化学品等，也可能损伤指甲，导致出现小坑。
2.影响因素：年龄上，雷诺病多见于中青年女性；长期接触化学物质的人群中各年龄段都有，但从事相关职业的成年人接触机会更多。生活方式中，经常涂抹劣质指甲油的女性，指甲受化学物质损伤风险增加；从事化工等相关职业的人群，接触有害化学物质概率高，指甲出现小坑风险大。有雷诺病等系统性疾病病史的人群，指甲出现小坑的可能性更高。
