指甲凹凸不平可能由多种因素引起，包括营养缺乏（维生素缺乏及铁、锌等微量元素缺乏）、疾病因素（甲癣、扁平苔藓、银屑病等）以及其他因素（外伤、接触刺激性物质）。营养缺乏会影响指甲代谢与生长，疾病会破坏指甲结构或引发相关炎症，外伤和接触刺激性物质则会直接损伤指甲。
一、营养缺乏
1.维生素缺乏：当人体缺乏维生素A、B族维生素、维生素C、维生素D等时可能出现指甲凹凸不平。例如缺乏维生素A会影响皮肤和指甲的正常代谢，导致指甲表面不平整；维生素B族参与机体的新陈代谢，缺乏时可能干扰指甲的生长过程，引发凹凸情况。一般来说，长期挑食、节食的人群更容易出现这类营养缺乏情况，青少年处于生长发育阶段，对营养需求大，若饮食不均衡也易发生。
2.微量元素缺乏：铁、锌等微量元素缺乏也与指甲凹凸不平相关。铁是参与血红蛋白合成的重要元素，缺铁会影响指甲的营养供应，导致指甲质地改变；锌参与多种酶的合成，对细胞的生长和分化有重要作用，缺锌时指甲可能出现凹凸现象。长期素食者、胃肠道吸收功能不佳者等人群相对更易缺乏微量元素。
二、疾病因素
1.甲癣：由皮肤癣菌等真菌感染甲板及甲下组织引起的甲病，会导致指甲凹凸不平、增厚、变色等。真菌在指甲部位繁殖，破坏指甲的正常结构和生长，具有传染性，可通过直接接触或共用物品传播，免疫力较低的人群如糖尿病患者等更容易感染甲癣。
2.扁平苔藓：这是一种累及皮肤、黏膜、甲的慢性炎症性疾病，若累及指甲，可出现甲板变薄、纵嵴、凹凸不平等改变。其发病机制与自身免疫等因素有关，不同年龄段人群均可发病，女性相对更易受影响。
3.银屑病：银屑病患者约有5%会出现甲损害，表现为指甲凹坑（顶针状凹陷）、甲板增厚、变色等，这与银屑病累及甲床等组织有关，病情活动期时甲损害可能更明显，不同年龄、性别均可发病，生活方式方面，压力过大等可能诱发或加重银屑病病情，从而影响指甲状况。
三、其他因素
1.外伤：指甲受到挤压、碰撞等外伤时，可能导致甲床损伤，进而出现指甲凹凸不平。比如长期从事需要手部频繁受力工作的人群，像建筑工人等，指甲更容易受到外伤影响，不同年龄、性别都可能发生，外伤后若恢复不佳就可能遗留指甲异常。
2.接触刺激性物质：长期接触洗涤剂、有机溶剂等刺激性化学物质，会损伤指甲的角质层，影响指甲的正常生长，导致凹凸不平。家庭主妇因经常接触洗涤剂，美甲从业者长期接触美甲产品中的化学物质等，都属于这类易接触刺激性物质的人群，不同性别均有涉及，长期接触后指甲状况易受影响。
