脸上长黑痣受多种因素影响，遗传因素可致个体长黑痣几率相对较高；长期紫外线照射会刺激黑色素细胞产生过多黑色素从而形成黑痣；青春期、孕期等特殊时期体内激素水平波动引发的内分泌变化与脸上长黑痣相关；随年龄增长皮肤老化致细胞代谢功能下降，黑色素细胞功能紊乱易形成黑痣；某些慢性疾病及局部皮肤炎症等刺激也可能导致黑痣产生。
部分黑痣的形成与遗传有关。如果家族中有较多成员容易长黑痣，那么个体遗传相关基因后，长黑痣的几率可能相对较高。例如，某些遗传性综合征可能伴有特定类型和数量的黑痣表现。从遗传学角度来看，基因决定了细胞的一些生长发育特性，当相关基因出现特定变异或组合时，就可能影响黑色素细胞的分布、增殖等情况，从而导致黑痣在脸上出现。不同年龄段都可能受遗传因素影响，但遗传因素在个体出生时就已存在基础，后续可能随年龄增长等因素逐渐表现出黑痣。
紫外线照射
长期暴露在紫外线下是脸上长黑痣的重要诱因之一。紫外线会刺激皮肤中的黑色素细胞产生更多的黑色素。黑色素是一种保护皮肤免受紫外线伤害的物质，但过量的黑色素聚集就会形成黑痣。比如，长期从事户外工作且未做好防晒措施的人群，脸上出现黑痣的概率往往比防晒措施到位的人群要高。各个年龄段都可能因紫外线照射长黑痣，儿童时期皮肤娇嫩，若长时间接受紫外线照射，更易刺激黑色素细胞活跃，增加长黑痣风险；成年人长期日晒也会不断促使黑痣形成或增多。
内分泌因素
体内内分泌的变化也与脸上长黑痣相关。例如，青春期、孕期等特殊时期，体内激素水平波动较大。青春期时，性激素水平改变，可能影响黑色素细胞的功能；孕期女性体内雌激素、孕激素等水平大幅上升，会刺激黑色素细胞分泌黑色素，进而导致脸上出现黑痣。不同性别在这些特殊时期内分泌变化不同，女性在青春期、孕期等阶段相对更易受内分泌因素影响长黑痣，而男性在激素水平出现较大波动时也可能受影响，但相对女性可能程度有所不同。
皮肤老化
随着年龄的增长，皮肤逐渐老化，细胞代谢功能下降，黑色素细胞的功能也会出现紊乱。老化的皮肤中，黑色素细胞产生黑色素的调节机制不如年轻时稳定，容易导致黑色素局部聚集形成黑痣。一般来说，30岁以后这种皮肤老化导致黑痣形成的情况会逐渐增多，但也有个体差异，生活方式不健康、长期受不良环境因素影响等会加速皮肤老化进程，使黑痣更早出现或数量增多。
其他因素
某些慢性疾病可能间接影响黑痣的形成，不过相对较少见。另外，局部皮肤的炎症等刺激也可能导致黑痣产生，比如皮肤曾有过外伤、感染等情况，在修复过程中可能引起黑色素细胞异常聚集形成黑痣。
