孕酮低可由多种因素引起，内分泌系统方面有黄体功能不全致孕酮分泌减少、下丘脑-垂体-卵巢轴功能紊乱影响卵巢分泌孕酮能力；卵巢本身问题包括卵巢储备功能下降使卵泡发育异常影响孕酮分泌、卵巢疾病破坏卵巢组织干扰激素合成致孕酮减少；其他因素有全身性疾病如甲状腺功能减退症、糖尿病间接影响孕酮分泌，某些药物干扰激素代谢致孕酮低，还有长期熬夜、过度吸烟酗酒等不健康生活方式也会导致孕酮低。
一、内分泌系统因素
1.黄体功能不全：女性体内的黄体是分泌孕酮的重要结构，若黄体功能不全，其分泌孕酮的量就会减少。在正常的月经周期中，卵泡发育成熟后排卵，排卵后形成黄体，黄体分泌雌激素和孕酮来维持子宫内膜的分泌期变化，为受精卵着床做准备。如果黄体功能不全，就无法产生足够的孕酮。例如，有研究表明，在反复发生流产的女性中，黄体功能不全导致孕酮低的比例较高，这与黄体分泌孕酮不足影响胚胎着床及早期发育有关。
2.下丘脑-垂体-卵巢轴功能紊乱：下丘脑分泌促性腺激素释放激素，垂体分泌促卵泡生成素和促黄体生成素，它们共同调节卵巢的功能。当下丘脑-垂体-卵巢轴功能出现紊乱时，会影响到卵巢分泌孕酮的能力。比如，长期精神压力过大、过度节食等因素可能影响下丘脑的功能，导致促性腺激素释放激素分泌异常，进而影响垂体和卵巢的功能，使孕酮分泌减少。不同年龄段的女性，下丘脑-垂体-卵巢轴的功能受生活方式等因素影响的程度不同，年轻女性可能因过度减肥等生活方式问题导致该轴功能紊乱，而围绝经期女性则可能因自身内分泌的自然变化出现此情况。
二、卵巢本身的问题
1.卵巢储备功能下降：随着年龄的增长，女性卵巢储备功能会逐渐下降，卵巢内的卵泡数量减少，质量也会变差。卵巢储备功能下降时，卵泡发育可能异常，影响孕酮的分泌。一般来说，35岁以上的女性卵巢储备功能开始逐渐下降，这部分女性相对更容易出现孕酮低的情况。例如，通过检测抗苗勒管激素（AMH）等指标可以评估卵巢储备功能，AMH水平降低往往提示卵巢储备功能下降，可能伴随孕酮分泌异常。
2.卵巢疾病：某些卵巢疾病也会影响孕酮的分泌，如卵巢肿瘤等。卵巢肿瘤可能会破坏卵巢的正常组织，影响其分泌激素的功能，包括孕酮的分泌。不同性质的卵巢肿瘤对孕酮分泌的影响机制不同，一些肿瘤可能会干扰激素合成相关的酶系统，从而导致孕酮分泌减少。
三、其他因素
1.全身性疾病：一些全身性疾病也可能导致孕酮低。例如，甲状腺功能减退症，甲状腺激素对女性的内分泌功能有重要调节作用，甲状腺功能减退时，会影响下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，进而影响孕酮的分泌。患有糖尿病等全身性疾病的女性，也可能因为疾病对身体代谢等多方面的影响，间接导致孕酮分泌异常。不同全身性疾病对孕酮影响的机制各异，糖尿病可能通过影响身体的糖代谢、胰岛素分泌等，干扰激素分泌相关的代谢途径，从而影响孕酮水平。
2.药物影响：某些药物也可能影响孕酮的水平。例如，长期使用某些抗癫痫药物等，可能会干扰体内的激素代谢过程，导致孕酮分泌减少。不同药物对孕酮的影响机制不同，抗癫痫药物可能通过影响肝脏酶系统对激素的代谢，从而影响孕酮的浓度。在使用这些药物的患者中，需要密切监测孕酮水平，尤其是有生育计划或已怀孕的女性，因为孕酮低可能会对妊娠产生不利影响。
3.生活方式因素：不健康的生活方式也与孕酮低有一定关系。长期熬夜会影响人体的内分泌节律，干扰下丘脑-垂体-卵巢轴的正常功能，导致孕酮分泌异常。过度吸烟、酗酒等不良生活习惯也可能对内分泌系统产生不良影响，进而影响孕酮的分泌。年轻女性中，因长期熬夜、作息不规律等生活方式问题导致孕酮低的情况较为常见，而长期酗酒的女性，无论年龄大小，都可能出现内分泌紊乱，影响孕酮水平。
